More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1051 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  72.55 
 
 		 493 aa  638    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 509 aa  1007    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  76.99 
 
 		 505 aa  692    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  71.15 
 
 		 515 aa  657    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  79.62 
 
 		 515 aa  701    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  71.28 
 
 		 553 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  71.91 
 
 		 521 aa  622  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  71.95 
 
 		 522 aa  621  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  67.11 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  69.33 
 
 		 501 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  66.11 
 
 		 517 aa  585  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  69.39 
 
 		 546 aa  585  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  67.41 
 
 		 494 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  68.58 
 
 		 530 aa  569  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  67.48 
 
 		 485 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  66.24 
 
 		 503 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  62.7 
 
 		 482 aa  558  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  64.97 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  63.45 
 
 		 493 aa  558  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  64.48 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  65.57 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  65.41 
 
 		 512 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  65.84 
 
 		 512 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  67.11 
 
 		 524 aa  532  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  61.71 
 
 		 484 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  66.08 
 
 		 480 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  60.43 
 
 		 487 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  59.38 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  61.02 
 
 		 501 aa  509  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  63.74 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  66.67 
 
 		 466 aa  505  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  63.99 
 
 		 483 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  63.77 
 
 		 483 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  63.77 
 
 		 483 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  64.03 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  63.47 
 
 		 494 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  63.88 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  63.44 
 
 		 495 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  46.41 
 
 		 421 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  47.61 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.91 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  47.37 
 
 		 454 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  43.66 
 
 		 395 aa  329  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.42 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  60.06 
 
 		 384 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  47.19 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  45.57 
 
 		 436 aa  324  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  44.94 
 
 		 433 aa  315  9e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  49.36 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.34 
 
 		 582 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45 
 
 		 444 aa  312  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  45.99 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.45 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.9 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  42.54 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  40.96 
 
 		 415 aa  306  7e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  42.96 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.93 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.69 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  40.44 
 
 		 419 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.69 
 
 		 419 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.69 
 
 		 419 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.44 
 
 		 419 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  40.69 
 
 		 419 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  45.54 
 
 		 421 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.15 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.69 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.69 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  42.78 
 
 		 430 aa  300  6e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  42.42 
 
 		 401 aa  299  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  40.24 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  43.35 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  47.38 
 
 		 414 aa  293  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  42.72 
 
 		 596 aa  292  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  47.11 
 
 		 414 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  42.62 
 
 		 489 aa  289  7e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  42.15 
 
 		 433 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  41.92 
 
 		 433 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  42.62 
 
 		 489 aa  289  9e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  40.54 
 
 		 401 aa  289  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  42.12 
 
 		 405 aa  286  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.79 
 
 		 417 aa  286  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  42.79 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  42.51 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  43.75 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  43.85 
 
 		 428 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  43.85 
 
 		 428 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  44.66 
 
 		 439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  41.9 
 
 		 406 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.72 
 
 		 426 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  43.59 
 
 		 428 aa  283  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  43.21 
 
 		 426 aa  282  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  42.96 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  42.96 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  42.96 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  42.96 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  42.96 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  42.96 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  42.96 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.85 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>