More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2535 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  90.6 
 
 
387 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  86.33 
 
 
396 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  83.04 
 
 
387 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  86.84 
 
 
396 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  90.88 
 
 
387 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  90.6 
 
 
387 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  90.31 
 
 
387 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  89.89 
 
 
392 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  87.09 
 
 
396 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  83 
 
 
392 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  99.26 
 
 
404 aa  801    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  90.6 
 
 
387 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  86.8 
 
 
395 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  86.84 
 
 
396 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  87.22 
 
 
414 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  86.8 
 
 
395 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
404 aa  809    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2080  small GTP-binding protein domain-containing protein  67.12 
 
 
414 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2100  small GTP-binding protein domain-containing protein  65.35 
 
 
411 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1221  hypothetical protein  65.17 
 
 
417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00041238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1065  GTP-binding proten HflX  64.54 
 
 
417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1157  GTP-binding proten HflX  64.54 
 
 
417 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  63.97 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  61.95 
 
 
385 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0446  small GTP-binding protein domain-containing protein  64.12 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  63.41 
 
 
389 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  58.24 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  60.85 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  59.89 
 
 
435 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  56.87 
 
 
429 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  58.22 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  58.47 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  61.19 
 
 
417 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  57.94 
 
 
382 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  58.33 
 
 
433 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  59.32 
 
 
435 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  58.06 
 
 
433 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  59.34 
 
 
432 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  58.59 
 
 
431 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  59.89 
 
 
435 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  58.92 
 
 
432 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  59.6 
 
 
435 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  59.89 
 
 
435 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  59.6 
 
 
435 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  59.6 
 
 
435 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  59.89 
 
 
435 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  59.44 
 
 
435 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  57.06 
 
 
441 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  59.32 
 
 
435 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  59.32 
 
 
435 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  59.05 
 
 
433 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  59.05 
 
 
433 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  59.05 
 
 
433 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  58.22 
 
 
433 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  58.36 
 
 
429 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  60 
 
 
433 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  58.36 
 
 
429 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  57.02 
 
 
436 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  58.24 
 
 
428 aa  378  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  58.07 
 
 
429 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  58.71 
 
 
432 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  58.58 
 
 
440 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1990  putative GTP-binding protein  59.94 
 
 
414 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.0213321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  57.79 
 
 
426 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1588  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.45 
 
 
375 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000278278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2602  GTP-binding protein, HSR1-related  56.03 
 
 
386 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415025  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  60.45 
 
 
404 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2862  GTP-binding proten HflX  55.11 
 
 
412 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  57.81 
 
 
432 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  55.34 
 
 
426 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  55.34 
 
 
426 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  55.07 
 
 
426 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  55.07 
 
 
426 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  56.02 
 
 
433 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  55.34 
 
 
426 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  55.52 
 
 
428 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  55.34 
 
 
426 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  55.07 
 
 
426 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  55.07 
 
 
426 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1176  small GTP-binding protein  59.68 
 
 
392 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668458  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  55.34 
 
 
426 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  55.34 
 
 
426 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  55.34 
 
 
426 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2193  GTP-binding proten HflX  60.5 
 
 
389 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1096  GTP-binding proten HflX  59.95 
 
 
392 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  55.34 
 
 
426 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  55.62 
 
 
426 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  55.34 
 
 
426 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  55.11 
 
 
430 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  55.07 
 
 
426 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1430  GTP-binding protein  60.72 
 
 
390 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224081  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1878  GTP-binding protein, HSR1-related  55.19 
 
 
383 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.932644  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  57.39 
 
 
454 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  56.98 
 
 
441 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  57.39 
 
 
454 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  55.59 
 
 
439 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1285  GTP-binding protein, HSR1-related  61.18 
 
 
387 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0074  GTP-binding protein, HSR1-related  59.12 
 
 
387 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  55.15 
 
 
426 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.07 
 
 
436 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>