More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1408 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 441 aa  886    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  53.58 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  54.65 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  54.25 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  53.1 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  50.85 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  50.23 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  49.19 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  48.4 
 
 		 415 aa  364  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  49.18 
 
 		 436 aa  363  5.0000000000000005e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  44.4 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  49.88 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.82 
 
 		 582 aa  346  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  51.98 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  48.79 
 
 		 422 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.57 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  43.91 
 
 		 509 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  52.39 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  45.32 
 
 		 502 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  45.15 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  52.35 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  46.84 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  52.02 
 
 		 380 aa  326  5e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  48.18 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  43.32 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  43.32 
 
 		 419 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  43.32 
 
 		 419 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  43.07 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  46.08 
 
 		 521 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  46.5 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  46.5 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  52.27 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  45.43 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  43.07 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  43.07 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  43.07 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  45.37 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  45.95 
 
 		 420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  43.07 
 
 		 419 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.75 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  43.07 
 
 		 419 aa  319  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  46.33 
 
 		 395 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  46.1 
 
 		 429 aa  319  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  51.34 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  45.66 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  42.57 
 
 		 419 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  45.39 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  46.33 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  44.53 
 
 		 596 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  46.15 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.31 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  46.83 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  46.1 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  46.25 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  45.39 
 
 		 530 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  46.6 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  46.6 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  46.08 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  46.08 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  44.77 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  46.08 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  46.08 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  46.08 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  46.08 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  46.08 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  46.33 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  46.33 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  46.35 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  46.33 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  46.33 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  46.08 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  44.65 
 
 		 401 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  50.78 
 
 		 407 aa  313  4.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  45.78 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  45.78 
 
 		 428 aa  313  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  45.78 
 
 		 428 aa  313  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  44.47 
 
 		 494 aa  313  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  46.33 
 
 		 426 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  46.91 
 
 		 487 aa  312  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  44.44 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  45.66 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.91 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  45.48 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  44.26 
 
 		 501 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.45 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  43.84 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  45.32 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  46.17 
 
 		 426 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  45.36 
 
 		 414 aa  310  5e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.48 
 
 		 489 aa  310  5e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  45.48 
 
 		 426 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  47.51 
 
 		 432 aa  310  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  45.41 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  50.32 
 
 		 401 aa  309  8e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  45.36 
 
 		 414 aa  308  9e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.22 
 
 		 489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.61 
 
 		 421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  43.24 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.29 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  46.08 
 
 		 493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>