More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1886 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  100 
 
 		 406 aa  832    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  66.41 
 
 		 401 aa  551  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  63.73 
 
 		 409 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  62.53 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  61.46 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  57.64 
 
 		 426 aa  451  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  57.88 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  55.3 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  52.74 
 
 		 395 aa  431  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  55.67 
 
 		 392 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  52.22 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  49.51 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  49.01 
 
 		 434 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.91 
 
 		 431 aa  352  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  47.96 
 
 		 434 aa  348  8e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  46.76 
 
 		 433 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  45.85 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  47.32 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.52 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  47.55 
 
 		 441 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  44.99 
 
 		 396 aa  302  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  45.66 
 
 		 387 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  45.66 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  45.66 
 
 		 387 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  45.66 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  45.66 
 
 		 387 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  45.66 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  45.38 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  46.13 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  43.48 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  45.4 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  44.44 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  45.43 
 
 		 396 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  45.4 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  45.4 
 
 		 404 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  44.99 
 
 		 396 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  45.21 
 
 		 454 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  44.72 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  42.97 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  46.52 
 
 		 384 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  47.14 
 
 		 419 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  44.44 
 
 		 419 aa  292  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.48 
 
 		 454 aa  292  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  42.93 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  46.33 
 
 		 432 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2080  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.07 
 
 		 414 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  45.9 
 
 		 421 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  43.34 
 
 		 433 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  43.4 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  43.08 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  44.5 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  44.39 
 
 		 437 aa  286  4e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  43.85 
 
 		 440 aa  286  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  43.68 
 
 		 441 aa  285  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  49.24 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  42.78 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  44.77 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  44.94 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  44.78 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  43.25 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  47.43 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  44.66 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  45.51 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  47.13 
 
 		 419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  42.05 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  48 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  44.92 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  47.13 
 
 		 419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  47.13 
 
 		 419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  47.43 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  43.61 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  49.09 
 
 		 432 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  45.85 
 
 		 419 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  45.85 
 
 		 419 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2100  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.97 
 
 		 411 aa  282  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  44 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  41.78 
 
 		 450 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  47.13 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  42.74 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  42.74 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  48.72 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  48.1 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  42.74 
 
 		 433 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.83 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.04 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  46.83 
 
 		 419 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  42.08 
 
 		 433 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.56 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  42.51 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  43.43 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  46.03 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  42.9 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  42.82 
 
 		 481 aa  275  7e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  43.5 
 
 		 429 aa  275  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  44.26 
 
 		 435 aa  276  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  42.38 
 
 		 426 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  43.73 
 
 		 426 aa  275  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  44.76 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  42.67 
 
 		 415 aa  275  9e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>