More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2311 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0382  putative GTP-binding protein, transporter associated  78.88 
 
 		 555 aa  818    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.506856  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2311  putative GTP-binding protein, transporter associated  100 
 
 		 558 aa  1091    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.303102 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02571  putative GTP-binding protein, transport associated  66.13 
 
 		 558 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  41.56 
 
 		 564 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  41.95 
 
 		 564 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  51.23 
 
 		 553 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  52.33 
 
 		 535 aa  303  6.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  38.54 
 
 		 574 aa  296  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  38.33 
 
 		 583 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  50.84 
 
 		 528 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  45.72 
 
 		 434 aa  270  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.25 
 
 		 417 aa  269  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  46.18 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  50.76 
 
 		 441 aa  267  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  45.45 
 
 		 407 aa  267  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  44.28 
 
 		 409 aa  266  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.75 
 
 		 431 aa  263  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  47.67 
 
 		 442 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  46.31 
 
 		 435 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  40.47 
 
 		 401 aa  263  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  45.43 
 
 		 413 aa  263  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  46.07 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  37 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  45.83 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  44.81 
 
 		 433 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  45.9 
 
 		 435 aa  258  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  45.12 
 
 		 423 aa  258  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  37.22 
 
 		 561 aa  257  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  50.65 
 
 		 425 aa  257  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  50.65 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  50.32 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  42.38 
 
 		 406 aa  255  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  50.32 
 
 		 424 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  50.65 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.75 
 
 		 414 aa  255  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.75 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  50.32 
 
 		 425 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  38.89 
 
 		 419 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  44.35 
 
 		 429 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.88 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  50 
 
 		 425 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  38.89 
 
 		 419 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  38.89 
 
 		 419 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  38.89 
 
 		 419 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  38.89 
 
 		 419 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.95 
 
 		 421 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.6 
 
 		 433 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  38.89 
 
 		 419 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  46.54 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  46.99 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  38.62 
 
 		 419 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  49.68 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  45.41 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.23 
 
 		 582 aa  250  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  38.07 
 
 		 540 aa  250  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  38.62 
 
 		 401 aa  250  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  38.36 
 
 		 419 aa  250  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  44.78 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  45.38 
 
 		 435 aa  250  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  44.07 
 
 		 406 aa  249  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  44.41 
 
 		 509 aa  249  7e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  45.65 
 
 		 434 aa  249  8e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  44.07 
 
 		 420 aa  249  9e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.1 
 
 		 419 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  45.11 
 
 		 435 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  45.11 
 
 		 435 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  48.08 
 
 		 422 aa  249  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  46.72 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  46.75 
 
 		 395 aa  248  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  42.9 
 
 		 412 aa  248  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  47.09 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  44.26 
 
 		 435 aa  248  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  37.57 
 
 		 419 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  42.94 
 
 		 412 aa  247  4e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  41.81 
 
 		 464 aa  247  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  43.85 
 
 		 429 aa  246  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  38.79 
 
 		 569 aa  246  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  45.61 
 
 		 436 aa  246  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  44.84 
 
 		 435 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  47.59 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  47.03 
 
 		 421 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  47.59 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.74 
 
 		 426 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  47.29 
 
 		 435 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  47.29 
 
 		 435 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.09 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  43.75 
 
 		 426 aa  243  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  39.73 
 
 		 458 aa  243  6e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.75 
 
 		 426 aa  243  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  43.88 
 
 		 435 aa  243  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  42.74 
 
 		 426 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  46.69 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  42.74 
 
 		 426 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  42.74 
 
 		 426 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  42.74 
 
 		 426 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  42.74 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  42.74 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  42.74 
 
 		 426 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  42.74 
 
 		 426 aa  242  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.24 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>