More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3023 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  62.48 
 
 		 549 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 540 aa  1081    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  57.94 
 
 		 561 aa  578  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  57.97 
 
 		 655 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  61.65 
 
 		 490 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  62.34 
 
 		 547 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  51.78 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  51.31 
 
 		 607 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  51.31 
 
 		 607 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  50.75 
 
 		 608 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  47.52 
 
 		 565 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  49.35 
 
 		 599 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  49.62 
 
 		 547 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  47.82 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  48.04 
 
 		 546 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  47.01 
 
 		 555 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  47.78 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  47.43 
 
 		 580 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.79 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  47.78 
 
 		 557 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  46.14 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  48.35 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  46.41 
 
 		 560 aa  378  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  46.12 
 
 		 555 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  40.07 
 
 		 553 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  40.64 
 
 		 574 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  40.03 
 
 		 583 aa  345  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  40.74 
 
 		 564 aa  343  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  40.74 
 
 		 564 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  42.58 
 
 		 582 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  40.12 
 
 		 528 aa  320  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  51.65 
 
 		 395 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  51.18 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  55.27 
 
 		 422 aa  312  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  38.12 
 
 		 596 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  41.41 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  49.72 
 
 		 421 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  54.81 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  50.8 
 
 		 509 aa  300  6e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  52.41 
 
 		 413 aa  297  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  51.96 
 
 		 461 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  48 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  39.12 
 
 		 530 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  46.39 
 
 		 512 aa  294  3e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  47.65 
 
 		 479 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  49.68 
 
 		 415 aa  293  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  46.09 
 
 		 435 aa  293  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  37.36 
 
 		 597 aa  293  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  37.36 
 
 		 597 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  46.31 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  46.76 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  48.66 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  50.15 
 
 		 487 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  47.59 
 
 		 503 aa  290  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  48.01 
 
 		 493 aa  289  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  50.31 
 
 		 454 aa  289  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  48.8 
 
 		 521 aa  289  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  46.99 
 
 		 406 aa  287  4e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  50.48 
 
 		 420 aa  286  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  46.29 
 
 		 502 aa  286  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  42.02 
 
 		 419 aa  286  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 		 484 aa  286  9e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  47.06 
 
 		 403 aa  286  9e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  46.74 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  42.3 
 
 		 419 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  47.06 
 
 		 512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  47.04 
 
 		 440 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  49.26 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  49.26 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  46.5 
 
 		 530 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  49.26 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.15 
 
 		 486 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  46.57 
 
 		 434 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  46.26 
 
 		 501 aa  282  9e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  50.15 
 
 		 423 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  50.8 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  52.08 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  51.48 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  51.12 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  51.84 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.35 
 
 		 493 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  47.35 
 
 		 431 aa  280  4e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.96 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  48.01 
 
 		 433 aa  279  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  46.49 
 
 		 512 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  45.91 
 
 		 401 aa  279  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  49.42 
 
 		 380 aa  278  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  47.83 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  46.56 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  46.76 
 
 		 546 aa  277  3e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  47.81 
 
 		 515 aa  277  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.34 
 
 		 419 aa  276  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  49.23 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  46.33 
 
 		 553 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  46.98 
 
 		 485 aa  276  8e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  46.18 
 
 		 522 aa  276  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.34 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  47.79 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  48.77 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  45.02 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>