More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2895 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  68.98 
 
 		 555 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  71.48 
 
 		 546 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  100 
 
 		 580 aa  1152    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  66.3 
 
 		 557 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  67.39 
 
 		 560 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  66.3 
 
 		 557 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  68.54 
 
 		 516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  60.91 
 
 		 547 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  50.81 
 
 		 599 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  46.94 
 
 		 565 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  49.18 
 
 		 563 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  51.27 
 
 		 532 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  50.63 
 
 		 608 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  50.63 
 
 		 607 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  50.63 
 
 		 607 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  47.43 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  46.81 
 
 		 561 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  46.84 
 
 		 549 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  52.22 
 
 		 490 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  47.06 
 
 		 655 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  42.81 
 
 		 569 aa  365  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  41.51 
 
 		 574 aa  349  8e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  41.9 
 
 		 583 aa  348  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  43.74 
 
 		 560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  42.21 
 
 		 555 aa  339  7e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  51.32 
 
 		 547 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  41.49 
 
 		 564 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  41.49 
 
 		 564 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  41.07 
 
 		 596 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  56.92 
 
 		 422 aa  319  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  43.22 
 
 		 528 aa  319  9e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  40.42 
 
 		 553 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.48 
 
 		 582 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  52.8 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  53.49 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  52.63 
 
 		 414 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  38.26 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  38.26 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  46.87 
 
 		 413 aa  298  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  42.42 
 
 		 535 aa  297  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  48.26 
 
 		 435 aa  290  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  44.48 
 
 		 412 aa  289  8e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  50.62 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  45.68 
 
 		 502 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  45.4 
 
 		 426 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  39.41 
 
 		 530 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  48.11 
 
 		 401 aa  286  9e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  45.13 
 
 		 426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  47.38 
 
 		 509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  43.8 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  43.8 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  46.75 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  43.8 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  43.8 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  43.8 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  43.8 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  43.8 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  43.8 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.51 
 
 		 429 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  48.52 
 
 		 521 aa  281  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.51 
 
 		 429 aa  281  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  45.77 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  43.8 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  43.57 
 
 		 412 aa  280  6e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  45.99 
 
 		 409 aa  280  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  45.77 
 
 		 426 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  45.77 
 
 		 426 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  45.77 
 
 		 426 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  45.77 
 
 		 426 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  48.11 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  43.45 
 
 		 426 aa  280  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  43.29 
 
 		 419 aa  279  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  47.02 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  46.22 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  46.39 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  46.03 
 
 		 414 aa  277  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  46.03 
 
 		 414 aa  277  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  45.74 
 
 		 430 aa  277  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  42.38 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  42.16 
 
 		 407 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  43.64 
 
 		 482 aa  276  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  43.18 
 
 		 426 aa  276  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  42.38 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  43.35 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  46.22 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  46.75 
 
 		 461 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  45.96 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  46.65 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  42.07 
 
 		 419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  39.08 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  42.07 
 
 		 419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  46.11 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  45.43 
 
 		 432 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.7 
 
 		 417 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  42.07 
 
 		 419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  42.07 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  42.07 
 
 		 419 aa  273  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  42.07 
 
 		 419 aa  273  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.92 
 
 		 493 aa  273  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  42.07 
 
 		 419 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>