More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11140 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  100 
 
 
395 aa  799    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  54.9 
 
 
421 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  53.11 
 
 
422 aa  362  6e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.75 
 
 
493 aa  358  7e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  45.36 
 
 
509 aa  349  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  52.96 
 
 
414 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  46.33 
 
 
502 aa  345  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.84 
 
 
441 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  48.62 
 
 
487 aa  342  9e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  51.02 
 
 
413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  47.06 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  46.6 
 
 
503 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  48.24 
 
 
442 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  45.34 
 
 
433 aa  333  3e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  46.8 
 
 
482 aa  332  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  45.1 
 
 
479 aa  332  9e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  47.73 
 
 
521 aa  329  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  47 
 
 
485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.83 
 
 
461 aa  326  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  50.52 
 
 
582 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  48.97 
 
 
420 aa  326  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  50.66 
 
 
420 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  48.95 
 
 
596 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 
517 aa  323  4e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  44.36 
 
 
484 aa  323  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  45.76 
 
 
515 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.31 
 
 
444 aa  322  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  51.64 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  44.86 
 
 
512 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.96 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.5 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  45.96 
 
 
437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  50.13 
 
 
406 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  47.99 
 
 
501 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  46.13 
 
 
493 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  44.97 
 
 
515 aa  319  7e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  50.13 
 
 
405 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.43 
 
 
486 aa  316  5e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  43.78 
 
 
512 aa  315  6e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  43.97 
 
 
530 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  43.29 
 
 
436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  44.84 
 
 
512 aa  313  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  46.52 
 
 
433 aa  312  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  45.09 
 
 
546 aa  309  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  47.01 
 
 
522 aa  309  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  50.29 
 
 
434 aa  309  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.55 
 
 
431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  49.7 
 
 
549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  51.21 
 
 
532 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  45.55 
 
 
434 aa  306  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 
505 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  46.54 
 
 
433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  46.59 
 
 
553 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 
464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.43 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  46.82 
 
 
524 aa  306  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  46.9 
 
 
553 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  51.1 
 
 
540 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  43.18 
 
 
419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  43.43 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  45.64 
 
 
450 aa  303  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  45.98 
 
 
494 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  45.39 
 
 
515 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.16 
 
 
429 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  42.43 
 
 
419 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  46.6 
 
 
597 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.72 
 
 
429 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  42.68 
 
 
419 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  44.47 
 
 
483 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  44.86 
 
 
493 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  45.65 
 
 
434 aa  299  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  42.82 
 
 
501 aa  300  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  52.85 
 
 
490 aa  299  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  48.33 
 
 
451 aa  299  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  44.22 
 
 
483 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  44.22 
 
 
483 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  46.67 
 
 
417 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  42.43 
 
 
419 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  42.43 
 
 
419 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  45.39 
 
 
494 aa  299  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  42.29 
 
 
419 aa  298  8e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  47.52 
 
 
561 aa  298  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  42.18 
 
 
419 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  42.18 
 
 
419 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  53.11 
 
 
528 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  44.99 
 
 
482 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.81 
 
 
415 aa  296  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  45.41 
 
 
480 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.95 
 
 
429 aa  296  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  43.85 
 
 
495 aa  296  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  46.12 
 
 
597 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  296  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  49.08 
 
 
420 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  45.73 
 
 
401 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  42.18 
 
 
419 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  43.22 
 
 
436 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  50.92 
 
 
375 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.42 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  43 
 
 
435 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  53.22 
 
 
401 aa  293  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>