More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1449 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  95.39 
 
 		 515 aa  813    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 494 aa  979    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  67.93 
 
 		 482 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  69.65 
 
 		 485 aa  595  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  66.45 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  72.4 
 
 		 466 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  66.88 
 
 		 493 aa  589  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  66.24 
 
 		 503 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  67.81 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  67.96 
 
 		 501 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  64.48 
 
 		 493 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  68.14 
 
 		 521 aa  571  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  65.68 
 
 		 479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  66.24 
 
 		 512 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  66.09 
 
 		 494 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  64.49 
 
 		 484 aa  565  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  65.16 
 
 		 517 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  64.37 
 
 		 509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  64.52 
 
 		 487 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  62.96 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  64.53 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  64.38 
 
 		 522 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  67.79 
 
 		 524 aa  551  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  66.23 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  68.78 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  63.01 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  66.21 
 
 		 515 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  66.52 
 
 		 493 aa  537  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  65.63 
 
 		 515 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  63.8 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  64.21 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  63.99 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  63.93 
 
 		 495 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  63.99 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  63.42 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  63.64 
 
 		 482 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  58.75 
 
 		 501 aa  477  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  56.12 
 
 		 512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.06 
 
 		 436 aa  336  5.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  51.19 
 
 		 422 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  41.98 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  57.73 
 
 		 384 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  45.43 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  45.63 
 
 		 414 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  47.3 
 
 		 582 aa  329  7e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  41.08 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  45.39 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.43 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.45 
 
 		 441 aa  326  6e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.19 
 
 		 419 aa  326  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.77 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  39.95 
 
 		 419 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  39.95 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  39.71 
 
 		 419 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  39.95 
 
 		 419 aa  325  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  39.95 
 
 		 419 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  39.95 
 
 		 419 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.88 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  45.41 
 
 		 433 aa  319  9e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  48.95 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  47.51 
 
 		 553 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  41.03 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  48.99 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.32 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.65 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  46.84 
 
 		 564 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  46.84 
 
 		 564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  42.03 
 
 		 596 aa  307  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.86 
 
 		 444 aa  305  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  43.55 
 
 		 431 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  41.94 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  45.06 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.84 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  43.59 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  43.34 
 
 		 434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  42.22 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  43.42 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.13 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.13 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  44.29 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  44.05 
 
 		 433 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  40.05 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  42.9 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  47.24 
 
 		 528 aa  296  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  45.26 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45.1 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  43.24 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.67 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  43.8 
 
 		 434 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  42.75 
 
 		 429 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  46.56 
 
 		 583 aa  293  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  42.75 
 
 		 429 aa  293  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  47.88 
 
 		 561 aa  292  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  42.82 
 
 		 426 aa  292  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  42.39 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.95 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  41.04 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  43.48 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  42.4 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  42.82 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>