More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_1719 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  100 
 
 		 415 aa  850    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  48.94 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  48.4 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  45.07 
 
 		 454 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  46.43 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.6 
 
 		 454 aa  345  7e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  43.03 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  43.87 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  44.07 
 
 		 502 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  40.96 
 
 		 509 aa  306  6e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  42.82 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  42.75 
 
 		 437 aa  299  5e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  42.33 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  44.09 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  43.84 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  42 
 
 		 484 aa  296  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  42.05 
 
 		 421 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  42.75 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  42.86 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.5 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  43.22 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  47.78 
 
 		 519 aa  292  9e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  41.46 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  44.75 
 
 		 450 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  43.88 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  44.01 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  43.31 
 
 		 414 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  42.61 
 
 		 433 aa  289  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  40.63 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.5 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  40.9 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  42.03 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  45.43 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.2 
 
 		 429 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  42.35 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  39.76 
 
 		 435 aa  285  9e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  44.41 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  44.39 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  41.06 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  45.53 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  40.79 
 
 		 515 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  41.62 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  42.9 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  45.04 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  43.88 
 
 		 439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  46.37 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  41.33 
 
 		 442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  42.45 
 
 		 474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  46.81 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.62 
 
 		 493 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  42.9 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  41.83 
 
 		 515 aa  282  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  39.9 
 
 		 522 aa  283  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  41.19 
 
 		 431 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  41.37 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  46.97 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  41.37 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  44 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  40.91 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  42.09 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  41.42 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  43.15 
 
 		 435 aa  280  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  41.42 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  44.29 
 
 		 433 aa  279  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  43.17 
 
 		 450 aa  279  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  41.94 
 
 		 444 aa  279  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  39.75 
 
 		 435 aa  279  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  41.42 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  41.06 
 
 		 530 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  42.86 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  45.09 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  39.72 
 
 		 505 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  41.35 
 
 		 436 aa  277  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  43.75 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  42.47 
 
 		 415 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  46.06 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  40.15 
 
 		 435 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  40.15 
 
 		 435 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  45.38 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  45.38 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  45.38 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  41.56 
 
 		 442 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  44.65 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  42.63 
 
 		 426 aa  275  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  42.67 
 
 		 406 aa  275  9e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  45.74 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  39.57 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  39.37 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  39.8 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  41.73 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  39.9 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  41.55 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  41.56 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  41.55 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  41.55 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  41.55 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  41.55 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  41.58 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  41.58 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  41.58 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>