More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0534 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 420 aa  847    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  47.29 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.44 
 
 		 441 aa  345  8e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  49.26 
 
 		 582 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  49.75 
 
 		 413 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  44.58 
 
 		 419 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  45.23 
 
 		 502 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  44.33 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  44.58 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  44.58 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  44.33 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  44.33 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  44.33 
 
 		 419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.69 
 
 		 493 aa  336  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  44.58 
 
 		 419 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  44.08 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.88 
 
 		 454 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  46.34 
 
 		 401 aa  333  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  45.99 
 
 		 509 aa  332  9e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  50.38 
 
 		 596 aa  328  8e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  43.58 
 
 		 419 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  47.31 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  43.17 
 
 		 415 aa  327  4.0000000000000003e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  48.97 
 
 		 395 aa  325  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.94 
 
 		 454 aa  325  8.000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  43.97 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  45.22 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  44.6 
 
 		 512 aa  316  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  43.58 
 
 		 433 aa  315  9e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.41 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  46.59 
 
 		 422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  45.62 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  44.71 
 
 		 493 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.35 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  44.74 
 
 		 501 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  44.98 
 
 		 512 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  43.61 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  54.4 
 
 		 424 aa  306  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  42.45 
 
 		 517 aa  307  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  44.05 
 
 		 515 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  42 
 
 		 479 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  54.4 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  54.4 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  54.4 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  54.09 
 
 		 354 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  54.4 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  45.89 
 
 		 414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  44.33 
 
 		 515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  42.86 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  53.77 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  53.77 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  41.71 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  44.1 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  43.07 
 
 		 503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  43.48 
 
 		 521 aa  303  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  46.23 
 
 		 597 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  43.84 
 
 		 493 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  54.09 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  44.61 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  46.23 
 
 		 597 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  45.52 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  50.15 
 
 		 553 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.47 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  51.39 
 
 		 415 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  42.45 
 
 		 512 aa  299  6e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  50.75 
 
 		 532 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  40.51 
 
 		 484 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  42.82 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  42.29 
 
 		 530 aa  297  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.47 
 
 		 429 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  54.4 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.93 
 
 		 486 aa  296  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  45.6 
 
 		 406 aa  295  9e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  43.93 
 
 		 417 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  45.04 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  45.81 
 
 		 494 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.23 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  42.04 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  42.57 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  47.13 
 
 		 464 aa  293  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  46.96 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  44.93 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  45.33 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  41.19 
 
 		 429 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  42.52 
 
 		 522 aa  292  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  41.65 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  41.75 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  44.17 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  43.38 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  45.14 
 
 		 553 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  43.65 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  48.77 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  46.94 
 
 		 375 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  43.65 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  45.3 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  43.65 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  50 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  42.33 
 
 		 414 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  41.34 
 
 		 419 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  43.09 
 
 		 426 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>