More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2081 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  100 
 
 		 582 aa  1173    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  58 
 
 		 596 aa  601  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  44.94 
 
 		 597 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  44.77 
 
 		 597 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  50.6 
 
 		 413 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  52.59 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  47.26 
 
 		 441 aa  372  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  51.38 
 
 		 422 aa  363  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  50.25 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  49.26 
 
 		 420 aa  347  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.17 
 
 		 493 aa  346  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  46.67 
 
 		 502 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  47.19 
 
 		 442 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  43.93 
 
 		 607 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  43.93 
 
 		 607 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  48.91 
 
 		 487 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  43.74 
 
 		 608 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  45.99 
 
 		 433 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  43.23 
 
 		 569 aa  336  7e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  47.17 
 
 		 503 aa  336  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  41.24 
 
 		 564 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  45.21 
 
 		 509 aa  335  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  41.24 
 
 		 564 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  44.15 
 
 		 435 aa  334  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  43.42 
 
 		 530 aa  333  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  48.66 
 
 		 501 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  43.48 
 
 		 560 aa  332  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  43.22 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  48.18 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  42.91 
 
 		 599 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  44.91 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  50.52 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.28 
 
 		 431 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  43.63 
 
 		 419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  40.52 
 
 		 574 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  40.86 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  41.91 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  38.55 
 
 		 553 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  44.88 
 
 		 482 aa  327  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  43.36 
 
 		 434 aa  326  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.68 
 
 		 486 aa  324  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  45.85 
 
 		 512 aa  325  2e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  45.5 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.48 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  43.26 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  41.37 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  44.55 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  42.8 
 
 		 555 aa  320  5e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.89 
 
 		 454 aa  320  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  44.77 
 
 		 521 aa  319  7.999999999999999e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  41.77 
 
 		 532 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  42.23 
 
 		 563 aa  319  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  42.23 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  44.95 
 
 		 501 aa  317  3e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.61 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  41.99 
 
 		 419 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  44.79 
 
 		 517 aa  317  4e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  43.87 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  41.99 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  41.99 
 
 		 419 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  41.99 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  41.52 
 
 		 419 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  46.83 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  46.91 
 
 		 493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  43.16 
 
 		 522 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  41.99 
 
 		 419 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  45.74 
 
 		 505 aa  313  4.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  45.01 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  41.77 
 
 		 419 aa  312  9e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  45.19 
 
 		 515 aa  311  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  43 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  41.42 
 
 		 565 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  43.75 
 
 		 484 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  43.41 
 
 		 479 aa  310  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  44.99 
 
 		 512 aa  310  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  45.07 
 
 		 426 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  37.96 
 
 		 583 aa  309  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  42.56 
 
 		 444 aa  309  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  43.97 
 
 		 426 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  44.42 
 
 		 437 aa  309  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  46.55 
 
 		 515 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  45.04 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  45.04 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  45.04 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  45.04 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  45.71 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  45.04 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  45.04 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  47.79 
 
 		 494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  45.04 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.82 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  44.69 
 
 		 524 aa  307  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  44.76 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  43.36 
 
 		 426 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  43.83 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  39.55 
 
 		 528 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  48.92 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  43.69 
 
 		 553 aa  306  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.84 
 
 		 429 aa  306  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  43.45 
 
 		 530 aa  306  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>