More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0410 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  94.09 
 
 		 406 aa  743    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  100 
 
 		 420 aa  831    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  51.27 
 
 		 421 aa  359  6e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  50.25 
 
 		 413 aa  345  7e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.21 
 
 		 421 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  48.99 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  41.65 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  41.83 
 
 		 437 aa  309  6.999999999999999e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  48.81 
 
 		 425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  42.75 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  42.26 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  44.41 
 
 		 487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  43.01 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.3 
 
 		 442 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  42.24 
 
 		 436 aa  302  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.3 
 
 		 493 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  45.52 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  42.18 
 
 		 509 aa  299  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1759  small GTP-binding protein  48.55 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000555556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  42.74 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  41.48 
 
 		 434 aa  296  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  40.05 
 
 		 479 aa  296  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  44.2 
 
 		 435 aa  295  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  44.03 
 
 		 553 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  38.73 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  43.01 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  43.01 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  43.01 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  40.1 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  42.74 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  42.9 
 
 		 503 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  46.2 
 
 		 434 aa  292  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  42.11 
 
 		 431 aa  292  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  42.48 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  41.71 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  41.29 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.08 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  39.8 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  40.9 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  41.07 
 
 		 502 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  46.07 
 
 		 582 aa  290  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  39.8 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  46.76 
 
 		 564 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  46.76 
 
 		 564 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  42.08 
 
 		 426 aa  289  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  40.41 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  40.6 
 
 		 429 aa  289  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.45 
 
 		 436 aa  288  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  42.62 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  43.49 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  39.8 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  39.89 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  46.06 
 
 		 412 aa  288  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  43.86 
 
 		 422 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  51.06 
 
 		 509 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  43.27 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  41.16 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  42.02 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  41.95 
 
 		 435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  46.69 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  41.95 
 
 		 435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  41.8 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  45.34 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  41.69 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  42.58 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  41.69 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  41.42 
 
 		 432 aa  286  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  48 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  42.26 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  43.05 
 
 		 515 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  43.63 
 
 		 440 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  41.53 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  42.43 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  39.49 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  45.74 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  41.95 
 
 		 485 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.58 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  42.48 
 
 		 432 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  42.08 
 
 		 546 aa  282  9e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  38.77 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  44.39 
 
 		 450 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  42.38 
 
 		 493 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  40 
 
 		 517 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  44.16 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  48.72 
 
 		 532 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  41.03 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  43.89 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  40 
 
 		 512 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  42.39 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  42.08 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>