More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3511 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  82.94 
 
 		 503 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 486 aa  958    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  65.83 
 
 		 502 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  71.43 
 
 		 512 aa  609  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  67.52 
 
 		 501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  69.8 
 
 		 485 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  69.51 
 
 		 493 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  67.01 
 
 		 512 aa  589  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  64.48 
 
 		 509 aa  588  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  65.77 
 
 		 521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  66.59 
 
 		 553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  68.94 
 
 		 494 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  65.81 
 
 		 522 aa  581  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  64.42 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  67.33 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  67.48 
 
 		 484 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  65.85 
 
 		 493 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  68.55 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  65.89 
 
 		 493 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  65.17 
 
 		 487 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  67.12 
 
 		 515 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  62.98 
 
 		 517 aa  550  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  68.22 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  68.44 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  68.22 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  63.68 
 
 		 494 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  64.03 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  66.52 
 
 		 546 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  68.2 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  67.78 
 
 		 482 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  65.04 
 
 		 515 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  62.6 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  66.44 
 
 		 530 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  66.38 
 
 		 482 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  66.14 
 
 		 524 aa  532  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  67.49 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  59.46 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  57.54 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  49.88 
 
 		 433 aa  361  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  48.45 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.55 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  46.6 
 
 		 421 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  52.62 
 
 		 422 aa  338  9e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  60.17 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  52.79 
 
 		 425 aa  330  4e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  43.2 
 
 		 437 aa  330  5.0000000000000004e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.63 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  44.33 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  45.78 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.65 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  42.86 
 
 		 413 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  44.31 
 
 		 596 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  46.15 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.16 
 
 		 461 aa  313  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  46.67 
 
 		 430 aa  310  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.2 
 
 		 419 aa  310  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  39.37 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1093  GTP-binding proten HflX  38.28 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000358907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  39.37 
 
 		 419 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  48.43 
 
 		 428 aa  306  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  38.89 
 
 		 419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  39.46 
 
 		 419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  38.65 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  38.89 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  42.25 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  39.13 
 
 		 419 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  46.26 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  42.48 
 
 		 420 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  37.41 
 
 		 419 aa  303  6.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  47.02 
 
 		 450 aa  302  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  39.13 
 
 		 419 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  39.13 
 
 		 419 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.31 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  45.66 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.72 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.39 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  43.88 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  45.66 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  41.86 
 
 		 519 aa  299  9e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.06 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.45 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  44.04 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  43.58 
 
 		 440 aa  296  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  45 
 
 		 435 aa  296  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  40.67 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  44.44 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  45.05 
 
 		 433 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  45.05 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.3 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  44.15 
 
 		 435 aa  295  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  45.05 
 
 		 433 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  43.38 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  42.79 
 
 		 431 aa  293  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  42.44 
 
 		 434 aa  293  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.72 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  42.72 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  46.78 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  42.72 
 
 		 414 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  44.13 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  40.34 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>