More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3837 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
493 aa  988    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  64.69 
 
 
502 aa  614  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  70.89 
 
 
485 aa  611  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  72.79 
 
 
501 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  69.68 
 
 
494 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  68 
 
 
553 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  69.35 
 
 
517 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  68.08 
 
 
522 aa  593  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  66.08 
 
 
509 aa  586  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  66.45 
 
 
487 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  63.99 
 
 
493 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  67.03 
 
 
512 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  68.43 
 
 
515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  69.51 
 
 
505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  68.86 
 
 
515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  66.82 
 
 
503 aa  571  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  65.8 
 
 
482 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  67.46 
 
 
515 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  66.88 
 
 
494 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  66.08 
 
 
486 aa  552  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  64.58 
 
 
479 aa  551  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  68.21 
 
 
546 aa  549  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  64.72 
 
 
521 aa  547  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  67.54 
 
 
466 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  68.55 
 
 
480 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  65.13 
 
 
493 aa  541  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  66.89 
 
 
524 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  62.95 
 
 
512 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  60.2 
 
 
484 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  65.59 
 
 
530 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  61.46 
 
 
483 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  61.24 
 
 
483 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  61.24 
 
 
483 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  62.69 
 
 
482 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  59.66 
 
 
495 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  61.82 
 
 
482 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  57.14 
 
 
501 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  55.26 
 
 
512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.24 
 
 
421 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  58.59 
 
 
384 aa  329  6e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  44.5 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  44.92 
 
 
436 aa  326  5e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  47.13 
 
 
414 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  44.68 
 
 
433 aa  320  5e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.26 
 
 
444 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  41.38 
 
 
419 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  46.42 
 
 
582 aa  316  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.56 
 
 
454 aa  315  9e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  43.99 
 
 
420 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  45.92 
 
 
442 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  47.5 
 
 
422 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  41.13 
 
 
419 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  41.13 
 
 
419 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  44.44 
 
 
413 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.89 
 
 
419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.53 
 
 
461 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.64 
 
 
419 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.64 
 
 
419 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.64 
 
 
419 aa  309  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  51.19 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.42 
 
 
454 aa  307  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.64 
 
 
419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.64 
 
 
419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  43.31 
 
 
434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  40.39 
 
 
419 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  43.86 
 
 
395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  45.92 
 
 
435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  48 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  46.88 
 
 
425 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  41.6 
 
 
401 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  47.64 
 
 
450 aa  300  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  41.23 
 
 
437 aa  300  5e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  43.03 
 
 
434 aa  299  6e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  46.89 
 
 
481 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.69 
 
 
440 aa  298  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.36 
 
 
429 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.23 
 
 
429 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  43 
 
 
431 aa  296  6e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  43.81 
 
 
489 aa  296  7e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  43.81 
 
 
489 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  43.31 
 
 
553 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  42.64 
 
 
406 aa  294  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  43.77 
 
 
433 aa  292  9e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  46.61 
 
 
433 aa  292  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  43.54 
 
 
435 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  47.25 
 
 
439 aa  291  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  41.2 
 
 
519 aa  290  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  49.71 
 
 
382 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  43.56 
 
 
432 aa  290  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  41.87 
 
 
426 aa  289  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.36 
 
 
426 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  43.84 
 
 
433 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  40.48 
 
 
415 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  42.71 
 
 
430 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  42.36 
 
 
426 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  41.87 
 
 
426 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  43.84 
 
 
433 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  42.36 
 
 
426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  42.04 
 
 
426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  42.36 
 
 
426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>