More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0684 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  79.16 
 
 		 493 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 512 aa  1015    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  69.68 
 
 		 485 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  65.2 
 
 		 502 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  70.41 
 
 		 501 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  71.27 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  65.19 
 
 		 503 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  68.26 
 
 		 486 aa  586  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  67.03 
 
 		 493 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  67.1 
 
 		 479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  65.63 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  65.87 
 
 		 522 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  67.74 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  65.08 
 
 		 517 aa  565  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  66.3 
 
 		 521 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  65.42 
 
 		 553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  67.17 
 
 		 493 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  66.67 
 
 		 515 aa  554  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  64.15 
 
 		 487 aa  554  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  62.88 
 
 		 484 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  65.27 
 
 		 482 aa  551  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  66.02 
 
 		 494 aa  548  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  66 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  67.2 
 
 		 530 aa  542  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  66.67 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  65.67 
 
 		 546 aa  541  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  67.11 
 
 		 524 aa  532  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  65.94 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  66.59 
 
 		 480 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  60.59 
 
 		 515 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  63.91 
 
 		 483 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  63.91 
 
 		 483 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  64.13 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  62.58 
 
 		 495 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  64.29 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  64.21 
 
 		 482 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  58.21 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  56.51 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  50.84 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.88 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.24 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  47.23 
 
 		 421 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  59.56 
 
 		 384 aa  343  5.999999999999999e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  45.56 
 
 		 414 aa  342  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  45.52 
 
 		 433 aa  340  4e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.01 
 
 		 582 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  51.21 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  44.86 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45.31 
 
 		 444 aa  329  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  41.55 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.28 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  44.5 
 
 		 420 aa  320  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  47.63 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.6 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.6 
 
 		 454 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  44.05 
 
 		 596 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  42.69 
 
 		 413 aa  309  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.57 
 
 		 417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.39 
 
 		 415 aa  305  9.000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  45 
 
 		 442 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  39.51 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  41.26 
 
 		 435 aa  302  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  45.87 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.54 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  44.25 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.91 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.05 
 
 		 436 aa  297  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  45.18 
 
 		 435 aa  296  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  38.78 
 
 		 419 aa  296  9e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  38.54 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  43.4 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  43.4 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  38.54 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  44.53 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  44.87 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  39.96 
 
 		 519 aa  294  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  46.27 
 
 		 401 aa  294  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  44.1 
 
 		 426 aa  294  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  38.54 
 
 		 419 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  38.29 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  44.87 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  43.21 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  38.29 
 
 		 419 aa  293  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  44.03 
 
 		 441 aa  293  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  42.75 
 
 		 429 aa  292  9e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  42.75 
 
 		 429 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  43.32 
 
 		 434 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  43.73 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  43.73 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  43.67 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  38.29 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  38.29 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  43.73 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  42.86 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  43.11 
 
 		 433 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.08 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  46.81 
 
 		 561 aa  289  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  40.98 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  44.47 
 
 		 450 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>