More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0658 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 425 aa  806    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  52.49 
 
 		 485 aa  335  9e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  49.36 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.64 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  48.51 
 
 		 502 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  51.66 
 
 		 503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  50.12 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  50.73 
 
 		 512 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  49.75 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.46 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  49.74 
 
 		 512 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  51.28 
 
 		 422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  45.11 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  48.66 
 
 		 521 aa  318  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  48.42 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  50.13 
 
 		 501 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  48.96 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  48.07 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.62 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  45.05 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  45.06 
 
 		 413 aa  310  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  48.97 
 
 		 420 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  48.34 
 
 		 494 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.79 
 
 		 486 aa  306  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  50.13 
 
 		 515 aa  306  7e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  48.74 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  48.38 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  48.35 
 
 		 546 aa  303  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.76 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  48.02 
 
 		 487 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  47.74 
 
 		 530 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  46.49 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  47.29 
 
 		 479 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  47.98 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  46.84 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  46 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.5 
 
 		 444 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  47.06 
 
 		 461 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  44.61 
 
 		 553 aa  295  8e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  44.91 
 
 		 522 aa  295  8e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  43.09 
 
 		 431 aa  295  9e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  49.12 
 
 		 524 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  45.89 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  44.86 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  44.85 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  42.89 
 
 		 481 aa  292  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  45.48 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  45.73 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  43.85 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  48.35 
 
 		 494 aa  290  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  43.68 
 
 		 395 aa  289  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  45.95 
 
 		 415 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  48.35 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  47.3 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  45.84 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  49.33 
 
 		 415 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  47.24 
 
 		 421 aa  285  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.54 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  44.85 
 
 		 428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  43.28 
 
 		 435 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  43.7 
 
 		 434 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  41.52 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  48.35 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  46.43 
 
 		 483 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  48.35 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1112  GTP-binding proten HflX  42.75 
 
 		 415 aa  282  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  46.43 
 
 		 483 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  48.39 
 
 		 445 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  49.29 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  42.57 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  46.17 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.65 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  43.26 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  43.26 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  45.5 
 
 		 596 aa  279  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  45.68 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  44.25 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  43.81 
 
 		 512 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  44.95 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  45.69 
 
 		 482 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  41.49 
 
 		 421 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  50.44 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  50.74 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  50.74 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  41.56 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  50.74 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  50.74 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  50.74 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  42.05 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  50.44 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  50.59 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  42.74 
 
 		 414 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  50.74 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  40.98 
 
 		 415 aa  276  6e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  42.66 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  45.08 
 
 		 409 aa  276  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.69 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  50.44 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  42.74 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  41.58 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>