More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4340 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 451 aa  898    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  50 
 
 		 413 aa  343  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  52.76 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  49.73 
 
 		 421 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  45.95 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  52.71 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  50.91 
 
 		 422 aa  319  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  52.42 
 
 		 433 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  47.77 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  48.32 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  47 
 
 		 431 aa  315  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  53.27 
 
 		 433 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  53.27 
 
 		 433 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  53.27 
 
 		 433 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  50.55 
 
 		 432 aa  315  9e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  42.64 
 
 		 454 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.56 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  47.03 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.29 
 
 		 454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  48.33 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  47.01 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.29 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  48.95 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  51.28 
 
 		 433 aa  310  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  51.34 
 
 		 414 aa  309  8e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  51.34 
 
 		 414 aa  309  8e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  47.85 
 
 		 435 aa  309  9e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  49.47 
 
 		 582 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  46.68 
 
 		 489 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  46.52 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  48.19 
 
 		 440 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  46.43 
 
 		 489 aa  307  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  48.19 
 
 		 417 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  53.59 
 
 		 392 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  53.59 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  44.42 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  53.59 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  53.59 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  53.59 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  53.59 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  53.59 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  53.59 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  46.6 
 
 		 428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  46.27 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  45.7 
 
 		 454 aa  303  5.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  42.34 
 
 		 415 aa  302  7.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  53.29 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  52.25 
 
 		 382 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  47.26 
 
 		 435 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  45.81 
 
 		 454 aa  302  7.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  47.26 
 
 		 435 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  51.76 
 
 		 389 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  49.01 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  47.26 
 
 		 435 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  47.01 
 
 		 435 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  47.26 
 
 		 435 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  47.26 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.79 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.25 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  51.13 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  47.26 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  51.72 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  51.72 
 
 		 414 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  49.17 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  46.07 
 
 		 430 aa  299  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  55.1 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  50.41 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  55.13 
 
 		 380 aa  298  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  52.69 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  44.03 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  47.01 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  47.01 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  53.27 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  52.69 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  52.69 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  52.69 
 
 		 396 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  49.7 
 
 		 429 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  52.4 
 
 		 396 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  45.32 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  45.14 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  45.14 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  45.14 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  45.14 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  45.14 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  44.77 
 
 		 503 aa  294  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0446  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.03 
 
 		 394 aa  294  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  46.11 
 
 		 450 aa  293  4e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  50 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  46.38 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  51.85 
 
 		 433 aa  293  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 		 435 aa  292  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  52.81 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  44.39 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  48.28 
 
 		 429 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  45.57 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  47.19 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  45.5 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  45.5 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  45.5 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  45.5 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>