More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0005 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 565 aa  1128    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  51.36 
 
 		 532 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  51.94 
 
 		 547 aa  452  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  50.83 
 
 		 599 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  47.52 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  51.75 
 
 		 607 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  51.75 
 
 		 608 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  51.75 
 
 		 607 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  49.02 
 
 		 557 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  46.99 
 
 		 561 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  46.32 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  47.13 
 
 		 563 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  47.96 
 
 		 555 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  50 
 
 		 557 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.54 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  46.11 
 
 		 655 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  49.02 
 
 		 560 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  45.24 
 
 		 546 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  45.14 
 
 		 580 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  49.78 
 
 		 490 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  42.76 
 
 		 569 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  48.42 
 
 		 547 aa  349  6e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  43.01 
 
 		 555 aa  347  5e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  42.2 
 
 		 560 aa  342  9e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  37.91 
 
 		 583 aa  330  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  38.77 
 
 		 574 aa  327  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  38.53 
 
 		 564 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  38.53 
 
 		 564 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  39.67 
 
 		 535 aa  312  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  41.42 
 
 		 582 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  37.37 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  37.37 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  39.2 
 
 		 596 aa  308  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  38.1 
 
 		 553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  39.55 
 
 		 528 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  46.69 
 
 		 421 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.46 
 
 		 441 aa  292  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  47.62 
 
 		 435 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.92 
 
 		 414 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  45.58 
 
 		 509 aa  283  6.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  46.61 
 
 		 395 aa  280  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  48.18 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  42.99 
 
 		 419 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  43.79 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  36.56 
 
 		 530 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  42.33 
 
 		 419 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  42.33 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  48.1 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  42.02 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  46.96 
 
 		 493 aa  267  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  42.02 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  42.02 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  42.02 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  44.85 
 
 		 530 aa  266  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.18 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  42.02 
 
 		 419 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  46.24 
 
 		 521 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  42.02 
 
 		 419 aa  266  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  41.72 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.51 
 
 		 414 aa  266  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  42.9 
 
 		 502 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.2 
 
 		 414 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  40.86 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  39.84 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  42.29 
 
 		 515 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  42.01 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  42.94 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  43.75 
 
 		 421 aa  260  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  44.86 
 
 		 440 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  40.19 
 
 		 503 aa  260  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  44.65 
 
 		 485 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.33 
 
 		 441 aa  259  7e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  45.24 
 
 		 553 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  42.99 
 
 		 412 aa  259  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  47.83 
 
 		 375 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  41.19 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  46.04 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  47.64 
 
 		 420 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  44.67 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  39.02 
 
 		 429 aa  257  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.85 
 
 		 493 aa  257  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  42.4 
 
 		 432 aa  257  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  41.03 
 
 		 426 aa  256  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.05 
 
 		 454 aa  256  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  42.94 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  39.94 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  45.8 
 
 		 512 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  40.59 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  45.87 
 
 		 517 aa  253  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  41.43 
 
 		 406 aa  253  6e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  41.69 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.74 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  41.64 
 
 		 420 aa  253  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  41.5 
 
 		 435 aa  253  7e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  42.6 
 
 		 441 aa  253  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  43.59 
 
 		 494 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  42.78 
 
 		 420 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  47.46 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.79 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  41.41 
 
 		 433 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>