More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2043 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  100 
 
 		 547 aa  1090    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  62.48 
 
 		 557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  61.99 
 
 		 546 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  62.13 
 
 		 555 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  62.48 
 
 		 557 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  60.91 
 
 		 580 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  62.89 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  60.44 
 
 		 560 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  56.46 
 
 		 599 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  56.64 
 
 		 607 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  56.83 
 
 		 607 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  56.64 
 
 		 608 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  53.51 
 
 		 563 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  51.94 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  53.09 
 
 		 532 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  50.74 
 
 		 561 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  50.7 
 
 		 549 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  49.62 
 
 		 540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  50.94 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  46.6 
 
 		 655 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  46.36 
 
 		 569 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  51.1 
 
 		 547 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  46.07 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  45.4 
 
 		 560 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  42.65 
 
 		 583 aa  363  5.0000000000000005e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  42.5 
 
 		 574 aa  360  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  42.31 
 
 		 564 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  42.52 
 
 		 564 aa  349  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  44.23 
 
 		 596 aa  333  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  39.24 
 
 		 553 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  43.75 
 
 		 528 aa  330  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  44.35 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  55.79 
 
 		 422 aa  320  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  40.18 
 
 		 597 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  40.18 
 
 		 597 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  43.44 
 
 		 535 aa  314  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  53.33 
 
 		 395 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  49.58 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  49.85 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  50.14 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  47.03 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  53.33 
 
 		 414 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  39.88 
 
 		 530 aa  293  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  47.43 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  48.3 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  44.07 
 
 		 412 aa  288  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  48.92 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  48.48 
 
 		 503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  48.09 
 
 		 509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  45.48 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  39.04 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  49.39 
 
 		 521 aa  281  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  47.8 
 
 		 409 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.11 
 
 		 454 aa  280  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  46.47 
 
 		 515 aa  280  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  45.65 
 
 		 454 aa  280  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  48.55 
 
 		 493 aa  280  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  48.12 
 
 		 442 aa  279  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  44.22 
 
 		 412 aa  279  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  46.13 
 
 		 401 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  46.88 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  46.53 
 
 		 530 aa  277  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  40.72 
 
 		 419 aa  277  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  47.53 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  47.65 
 
 		 479 aa  276  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  49.53 
 
 		 420 aa  276  9e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.44 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  45.4 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  46.42 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  40.44 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  47.37 
 
 		 522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  46.42 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  46.11 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  46.11 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  46.42 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  46.11 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  48.28 
 
 		 434 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  46.11 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  46.11 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.17 
 
 		 419 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.17 
 
 		 419 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.17 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.17 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  47.66 
 
 		 425 aa  273  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.43 
 
 		 493 aa  273  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.47 
 
 		 444 aa  273  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  46.65 
 
 		 407 aa  273  7e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  48.58 
 
 		 423 aa  273  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  47.66 
 
 		 425 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  47.66 
 
 		 354 aa  273  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.17 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.17 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  47.35 
 
 		 425 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.17 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>