More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1687 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  77.01 
 
 		 555 aa  817    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 560 aa  1101    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  53.92 
 
 		 569 aa  515  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  49.07 
 
 		 599 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  47.53 
 
 		 608 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  47.35 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  47.35 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  43.67 
 
 		 549 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  46.41 
 
 		 540 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  44.67 
 
 		 563 aa  359  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  43.22 
 
 		 561 aa  353  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  42.2 
 
 		 565 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  42.88 
 
 		 532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  45.4 
 
 		 547 aa  337  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.48 
 
 		 582 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  43.18 
 
 		 655 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  37.93 
 
 		 583 aa  322  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  44.27 
 
 		 557 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  41.8 
 
 		 596 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  40.18 
 
 		 564 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  40.18 
 
 		 564 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  43.72 
 
 		 546 aa  316  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  37.72 
 
 		 574 aa  314  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  40.04 
 
 		 553 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  44.46 
 
 		 560 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  54.06 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  44.24 
 
 		 555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  43.89 
 
 		 557 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.47 
 
 		 516 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  37.33 
 
 		 597 aa  297  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  37.33 
 
 		 597 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  45.65 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  43.28 
 
 		 580 aa  293  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0152  small GTP-binding protein  44.49 
 
 		 547 aa  282  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  48.9 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  40.83 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  47.38 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.05 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  39.96 
 
 		 530 aa  273  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  43.12 
 
 		 429 aa  270  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.78 
 
 		 429 aa  270  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  45.92 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  37.35 
 
 		 528 aa  266  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  38.18 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  45.79 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  47.65 
 
 		 421 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  47.43 
 
 		 501 aa  263  6.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  46.28 
 
 		 433 aa  263  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  45.68 
 
 		 434 aa  263  8.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  46.26 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  46.56 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  46.76 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  41.81 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  46.05 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  46.26 
 
 		 413 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  44.44 
 
 		 489 aa  261  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  42.74 
 
 		 435 aa  261  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  44.85 
 
 		 433 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  46.45 
 
 		 515 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  44.85 
 
 		 433 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  43.99 
 
 		 439 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  43.62 
 
 		 431 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  44.44 
 
 		 489 aa  260  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.09 
 
 		 493 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  44.85 
 
 		 433 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.69 
 
 		 442 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  43.7 
 
 		 426 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.43 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  43.98 
 
 		 435 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  45.13 
 
 		 433 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  45 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  46.69 
 
 		 482 aa  258  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  44.48 
 
 		 412 aa  258  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  46.94 
 
 		 493 aa  257  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.13 
 
 		 414 aa  257  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  42.63 
 
 		 432 aa  257  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.13 
 
 		 414 aa  256  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  42.97 
 
 		 403 aa  256  7e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  44.44 
 
 		 382 aa  256  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.65 
 
 		 436 aa  256  8e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  42.22 
 
 		 426 aa  256  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  43.03 
 
 		 479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  41.64 
 
 		 403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  47.62 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  45.94 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  44.75 
 
 		 502 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  43.18 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  46.48 
 
 		 503 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  43.14 
 
 		 428 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  43.14 
 
 		 428 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  43.14 
 
 		 428 aa  253  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  47.75 
 
 		 485 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  45.14 
 
 		 454 aa  253  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.72 
 
 		 454 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  51.43 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  45.81 
 
 		 433 aa  250  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.14 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  42.72 
 
 		 412 aa  250  5e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  47.51 
 
 		 487 aa  250  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.47 
 
 		 461 aa  250  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>