More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2724 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
530 aa  1070    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  44.24 
 
 
582 aa  349  9e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  42.05 
 
 
596 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  39.29 
 
 
597 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  39.29 
 
 
597 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  40.11 
 
 
569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  39.63 
 
 
549 aa  296  6e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  50.46 
 
 
421 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  38.94 
 
 
540 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  40.63 
 
 
532 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  41.37 
 
 
555 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  40.26 
 
 
560 aa  286  8e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  51.2 
 
 
422 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  34.22 
 
 
553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.88 
 
 
441 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  36.12 
 
 
574 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  36.56 
 
 
565 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  49.84 
 
 
413 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  47.13 
 
 
395 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  36.84 
 
 
564 aa  276  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  36.67 
 
 
561 aa  276  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  46.01 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  39.26 
 
 
599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  39.88 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  50.92 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  46.73 
 
 
401 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  46.73 
 
 
419 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  36.84 
 
 
564 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  46.41 
 
 
419 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  46.41 
 
 
419 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  46.5 
 
 
461 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  46.41 
 
 
419 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  39.13 
 
 
608 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  37.66 
 
 
607 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  46.41 
 
 
419 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  35.71 
 
 
583 aa  271  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  37.66 
 
 
607 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  46.41 
 
 
419 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  46.73 
 
 
419 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  46.41 
 
 
419 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  46.41 
 
 
419 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  47.42 
 
 
444 aa  269  8.999999999999999e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  49.22 
 
 
420 aa  269  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  38.4 
 
 
563 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  45.75 
 
 
419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.79 
 
 
429 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  44.75 
 
 
434 aa  267  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.03 
 
 
442 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  37.97 
 
 
546 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1365  GTP-binding protein, HSR1-related  46.2 
 
 
412 aa  264  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0434116  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  49.23 
 
 
403 aa  264  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1391  GTP-binding protein HSR1-related  46.2 
 
 
412 aa  264  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84706  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  49.22 
 
 
403 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  45.34 
 
 
412 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  50.16 
 
 
380 aa  263  6e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.48 
 
 
429 aa  263  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  44.58 
 
 
503 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  43.59 
 
 
454 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  46.9 
 
 
375 aa  262  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  38.6 
 
 
560 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  40.56 
 
 
431 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.87 
 
 
454 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  38.51 
 
 
557 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  45.4 
 
 
502 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  44.66 
 
 
509 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.42 
 
 
493 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  45.57 
 
 
415 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  39.8 
 
 
580 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  36.14 
 
 
528 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.75 
 
 
429 aa  257  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  41.35 
 
 
435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  39.74 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  41.72 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.27 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  46.36 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  43.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  43.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  43.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  43.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  43.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  43.3 
 
 
412 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  45.15 
 
 
493 aa  254  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  44.27 
 
 
440 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  41.21 
 
 
434 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  42.2 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  44.88 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  42.2 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  42.2 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  42.2 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  42.2 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  42.2 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  42.2 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  39.7 
 
 
557 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  46.39 
 
 
521 aa  253  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  42.9 
 
 
426 aa  253  7e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  43.83 
 
 
433 aa  253  8.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  44.55 
 
 
426 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.99 
 
 
426 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  42.24 
 
 
426 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  44.55 
 
 
401 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>