More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0737 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  100 
 
 		 380 aa  771    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  88.39 
 
 		 403 aa  659    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  90.24 
 
 		 403 aa  669    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  55.03 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  53.76 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  51.1 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  51.1 
 
 		 454 aa  345  8e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  57.55 
 
 		 444 aa  344  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  49.42 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.67 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  55.96 
 
 		 421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  47.09 
 
 		 415 aa  305  6e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  45.6 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.28 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.85 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  53.87 
 
 		 413 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  51.3 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  45.13 
 
 		 401 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  50 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  49.7 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  55.13 
 
 		 451 aa  288  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  48.68 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  48.68 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  51.53 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  47.09 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  44.2 
 
 		 409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  49.83 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  51.32 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  53.64 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  47.68 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  46.96 
 
 		 528 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  49.32 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  47.68 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  47.68 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  53.33 
 
 		 422 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  41.64 
 
 		 553 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  46.36 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  53.02 
 
 		 582 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  47.35 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  45.73 
 
 		 583 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  45.22 
 
 		 396 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  47.35 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  49.58 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  46.61 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  46.91 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  46.93 
 
 		 439 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  46.86 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  47.88 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  46.28 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  46.57 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  46.57 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  44.44 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  44.44 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  44.44 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  44.44 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  44.44 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  44.44 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  48.67 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  44.44 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  50.16 
 
 		 569 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  47.57 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  44.44 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  46.08 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  47.44 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  48.67 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  49 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  50 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  45.43 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  47.59 
 
 		 440 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  45.53 
 
 		 574 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  48.15 
 
 		 454 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.37 
 
 		 429 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  48.15 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  48.33 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  47.81 
 
 		 426 aa  272  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.13 
 
 		 436 aa  272  6e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  48.33 
 
 		 395 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  48.33 
 
 		 395 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  48.33 
 
 		 396 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  48.01 
 
 		 428 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  47.14 
 
 		 430 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  46.28 
 
 		 535 aa  272  9e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  53.22 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  47.56 
 
 		 509 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  48.01 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  48.67 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  48.01 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  48.67 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  49.33 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  48.67 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  49.33 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  47.19 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  48.67 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  48.67 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 		 564 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>