More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6253 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
426 aa  874    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  68.35 
 
 
411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  57.64 
 
 
406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  56.28 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  54.77 
 
 
395 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  54.55 
 
 
407 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  55.31 
 
 
396 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  56.62 
 
 
392 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  51.47 
 
 
409 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  55 
 
 
396 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  56.78 
 
 
442 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  52.53 
 
 
434 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  51.9 
 
 
431 aa  332  8e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  52.02 
 
 
433 aa  329  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  49.7 
 
 
434 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  52.27 
 
 
441 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  43.48 
 
 
435 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  52.85 
 
 
433 aa  318  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  49.25 
 
 
444 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  50 
 
 
434 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  47.13 
 
 
454 aa  299  8e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  46.55 
 
 
454 aa  295  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  46.83 
 
 
461 aa  293  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  45.51 
 
 
435 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  46.37 
 
 
415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  39.85 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  43.86 
 
 
435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  43.45 
 
 
435 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  45.4 
 
 
432 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  45.09 
 
 
429 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.21 
 
 
429 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  44.89 
 
 
431 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  43.08 
 
 
436 aa  280  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.04 
 
 
433 aa  279  5e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.51 
 
 
429 aa  280  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  44.48 
 
 
436 aa  279  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  39.81 
 
 
432 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  45.6 
 
 
396 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  45.6 
 
 
395 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  45.6 
 
 
396 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  45.6 
 
 
395 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  45.87 
 
 
384 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  40.57 
 
 
392 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  45.28 
 
 
396 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  44.58 
 
 
432 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  45.91 
 
 
396 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  39.16 
 
 
441 aa  277  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  46.23 
 
 
414 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  45.31 
 
 
387 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  45.6 
 
 
404 aa  276  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  45.6 
 
 
404 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  45.31 
 
 
387 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  45.31 
 
 
387 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  45.31 
 
 
392 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  45.31 
 
 
387 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  45.31 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  40.43 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  45.95 
 
 
437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  45 
 
 
387 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  45.91 
 
 
439 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.05 
 
 
429 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  39.1 
 
 
433 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  42.77 
 
 
435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  42.77 
 
 
435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  44.27 
 
 
435 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  47.15 
 
 
421 aa  272  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.47 
 
 
417 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  43.48 
 
 
433 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  38.56 
 
 
426 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  38.31 
 
 
426 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  44.27 
 
 
435 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  43.48 
 
 
433 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  44.27 
 
 
435 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  38.01 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  43.96 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  43.96 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  43.48 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  40.2 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  40.25 
 
 
429 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  38.31 
 
 
426 aa  269  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  43.07 
 
 
426 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  37.76 
 
 
433 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  41.89 
 
 
435 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  46.21 
 
 
382 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  46.05 
 
 
419 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  39.95 
 
 
440 aa  267  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  43.25 
 
 
428 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  44.44 
 
 
439 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  44.01 
 
 
433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2602  GTP-binding protein, HSR1-related  43.43 
 
 
386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415025  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  44.14 
 
 
412 aa  266  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  37.81 
 
 
428 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  37.81 
 
 
428 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  44.15 
 
 
428 aa  266  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  42.99 
 
 
385 aa  266  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.55 
 
 
436 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  42.17 
 
 
426 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  45.72 
 
 
419 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  45.78 
 
 
414 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  45.72 
 
 
419 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>