More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3840 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  100 
 
 
426 aa  865    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  99.77 
 
 
426 aa  862    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  84.71 
 
 
428 aa  746    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  72.2 
 
 
429 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  84.94 
 
 
428 aa  748    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  84.74 
 
 
426 aa  748    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  97.18 
 
 
426 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  100 
 
 
426 aa  865    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  84.51 
 
 
426 aa  746    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  865    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  99.77 
 
 
426 aa  863    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  96.95 
 
 
426 aa  850    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  97.18 
 
 
426 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  100 
 
 
426 aa  865    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  91.31 
 
 
426 aa  803    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  100 
 
 
426 aa  865    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  84.51 
 
 
433 aa  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  72.13 
 
 
429 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  84.74 
 
 
426 aa  747    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  85.92 
 
 
426 aa  751    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  84.94 
 
 
428 aa  748    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  100 
 
 
426 aa  865    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  100 
 
 
426 aa  865    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  97.18 
 
 
426 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  97.18 
 
 
426 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  71.96 
 
 
429 aa  627  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  70.49 
 
 
439 aa  624  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  66.43 
 
 
432 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  67.92 
 
 
429 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  67.38 
 
 
430 aa  593  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0580  GTP-binding protein hflX  67.13 
 
 
427 aa  591  1e-167  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  65.26 
 
 
428 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  65.73 
 
 
435 aa  561  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  64.55 
 
 
435 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  65.47 
 
 
432 aa  551  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  63.38 
 
 
435 aa  548  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  64.08 
 
 
435 aa  545  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  63.55 
 
 
431 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  64.55 
 
 
435 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  64.08 
 
 
435 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  64.08 
 
 
435 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  64.08 
 
 
435 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  63.15 
 
 
435 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  63.38 
 
 
435 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  63.15 
 
 
435 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  62.68 
 
 
432 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  63.38 
 
 
435 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  61.5 
 
 
458 aa  533  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  62.44 
 
 
432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  59.53 
 
 
441 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  62.11 
 
 
432 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  65.8 
 
 
417 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  61.07 
 
 
429 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  61.15 
 
 
433 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  60.91 
 
 
433 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  61.31 
 
 
439 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  59.33 
 
 
433 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  59.33 
 
 
433 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  58.85 
 
 
433 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  59.33 
 
 
433 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  60.64 
 
 
441 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  57.69 
 
 
489 aa  473  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  57.55 
 
 
489 aa  472  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  57.79 
 
 
481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  58.72 
 
 
433 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  57.97 
 
 
454 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  57.97 
 
 
454 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4941  GTP-binding protein HflX  58.85 
 
 
433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  59.09 
 
 
433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  56.52 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  56.52 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0573  GTP-binding protein, HSR1-related  58.61 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0524  GTP-binding protein, HSR1-like  59.81 
 
 
433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227372  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  57.38 
 
 
440 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  57.98 
 
 
433 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  57.62 
 
 
436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  64.18 
 
 
382 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.59 
 
 
436 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  54.61 
 
 
450 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  54.61 
 
 
450 aa  425  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  54.85 
 
 
428 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  52.39 
 
 
445 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  55.69 
 
 
421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  60.77 
 
 
385 aa  398  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  51.34 
 
 
432 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  51.34 
 
 
432 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  58.05 
 
 
387 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  58.05 
 
 
392 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0446  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.18 
 
 
394 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  57.76 
 
 
392 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  58.05 
 
 
387 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  58.05 
 
 
387 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  58.05 
 
 
387 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  57.76 
 
 
387 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  57.76 
 
 
387 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  57.47 
 
 
396 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  57.47 
 
 
396 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  57.47 
 
 
395 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  57.47 
 
 
396 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  57.47 
 
 
395 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>