More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2448 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  67.67 
 
 
564 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  66.18 
 
 
583 aa  666    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  67.43 
 
 
528 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  100 
 
 
535 aa  1068    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  67.86 
 
 
564 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  64.27 
 
 
574 aa  678    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  58.52 
 
 
553 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  49.17 
 
 
434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  53.56 
 
 
421 aa  319  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  44.62 
 
 
599 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0382  putative GTP-binding protein, transporter associated  43.64 
 
 
555 aa  317  3e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.506856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  43.8 
 
 
607 aa  316  8e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  43.8 
 
 
607 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  54.45 
 
 
422 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  43.42 
 
 
608 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  39.67 
 
 
565 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  42.65 
 
 
532 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  49.58 
 
 
442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  49.03 
 
 
435 aa  309  8e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02571  putative GTP-binding protein, transport associated  41.62 
 
 
558 aa  309  9e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  48.45 
 
 
433 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  47.78 
 
 
431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  50 
 
 
434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  41.5 
 
 
569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  42.49 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  42.08 
 
 
549 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  47.55 
 
 
401 aa  302  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  50 
 
 
414 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2311  putative GTP-binding protein, transporter associated  52.33 
 
 
558 aa  302  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.303102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  41.42 
 
 
409 aa  299  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  40 
 
 
582 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  41.41 
 
 
540 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.07 
 
 
441 aa  294  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  49.59 
 
 
415 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  46.89 
 
 
435 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  46.11 
 
 
433 aa  289  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  46.09 
 
 
434 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  41.73 
 
 
406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  42.72 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  50.28 
 
 
415 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  48.39 
 
 
461 aa  287  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.9 
 
 
414 aa  286  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.9 
 
 
414 aa  286  9e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  46.86 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  43.24 
 
 
547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  47.99 
 
 
454 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  47.43 
 
 
413 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  46.95 
 
 
454 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  49.04 
 
 
482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  42.25 
 
 
396 aa  283  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  49.86 
 
 
392 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  49.58 
 
 
392 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  48.82 
 
 
429 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  44.44 
 
 
458 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  49.58 
 
 
387 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  43.5 
 
 
563 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  49.58 
 
 
387 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  49.58 
 
 
387 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  49.58 
 
 
387 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  40 
 
 
596 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  47.2 
 
 
407 aa  281  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  49.58 
 
 
387 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.81 
 
 
493 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  47.11 
 
 
423 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  45.71 
 
 
406 aa  280  4e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  50.46 
 
 
405 aa  280  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  49.58 
 
 
396 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  49.44 
 
 
414 aa  280  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  47.63 
 
 
433 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  49.29 
 
 
387 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  45.95 
 
 
424 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  45.69 
 
 
425 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  42.48 
 
 
560 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  47.51 
 
 
429 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  45.98 
 
 
425 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  49.29 
 
 
396 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  47.04 
 
 
433 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  48.5 
 
 
429 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  49.29 
 
 
395 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  44.7 
 
 
436 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  49.29 
 
 
395 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  45.69 
 
 
425 aa  277  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  45.05 
 
 
433 aa  277  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  48.41 
 
 
428 aa  277  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  45.69 
 
 
425 aa  277  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  45.69 
 
 
354 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  46.82 
 
 
420 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  49.29 
 
 
396 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  49.29 
 
 
396 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  47.51 
 
 
503 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  45.18 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  45.18 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  45.18 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  45.4 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  46.28 
 
 
380 aa  274  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  48.59 
 
 
404 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  48.59 
 
 
404 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  47.59 
 
 
420 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  49.26 
 
 
395 aa  274  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  47.25 
 
 
426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>