More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1195 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  82.77 
 
 		 412 aa  715    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  100 
 
 		 412 aa  843    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0228  GTPase  57.25 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1391  GTP-binding protein HSR1-related  46.98 
 
 		 412 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1365  GTP-binding protein, HSR1-related  46.9 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0434116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  48.26 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  45.97 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  47.89 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  52.73 
 
 		 425 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  52.42 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  52.42 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  53.46 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  53.46 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  52.42 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  52.12 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0873  GTP-binding protein, putative  45.15 
 
 		 416 aa  319  7e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  52.12 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  47.76 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  41.99 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  46.11 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  43.42 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  48.24 
 
 		 441 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  46.72 
 
 		 413 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  47.34 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  47.34 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  48.16 
 
 		 433 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  47.34 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  47.34 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.56 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  47.34 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  47.34 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  47.34 
 
 		 392 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  47.58 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  48.16 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  47.65 
 
 		 395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  47.65 
 
 		 396 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  47.65 
 
 		 395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  47.65 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  47.34 
 
 		 387 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  47.34 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  49.66 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  47.32 
 
 		 433 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  40.92 
 
 		 435 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  47.92 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  47.32 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  47.32 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  46.58 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  46.71 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.99 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  47.34 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  47.34 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  45.11 
 
 		 431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  42.38 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.42 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  41.64 
 
 		 401 aa  282  8.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  46.08 
 
 		 414 aa  282  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  42.49 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  49.66 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  45.97 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  42.49 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  48.45 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  46.67 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  40.92 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  46.67 
 
 		 426 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  46.3 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  41.22 
 
 		 419 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  43.3 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  47.37 
 
 		 421 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  47.02 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  47.02 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  47.02 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  47.02 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  47.02 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.17 
 
 		 441 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  47.02 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  47.02 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  46.25 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  47.62 
 
 		 426 aa  276  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.46 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.46 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  47.02 
 
 		 426 aa  276  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  45.4 
 
 		 407 aa  275  8e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.46 
 
 		 419 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  42.78 
 
 		 426 aa  275  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  45.91 
 
 		 426 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  45.91 
 
 		 426 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  45.91 
 
 		 426 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  45.91 
 
 		 426 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  45.91 
 
 		 426 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  44.06 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  46.57 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  45.43 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.46 
 
 		 419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  40.97 
 
 		 419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  45.79 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  47.35 
 
 		 434 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.2 
 
 		 419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  44.24 
 
 		 434 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.96 
 
 		 441 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  46.52 
 
 		 481 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>