More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1093 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1093  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 438 aa  884    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000358907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  51.26 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  51.95 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  51.03 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  51.49 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  51.03 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  51.03 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  50.8 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  50.8 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  51.26 
 
 		 419 aa  438  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  50.58 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  53.65 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  46.58 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  45.9 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0155  GTPase  42.13 
 
 		 437 aa  322  7e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  41.11 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  38.16 
 
 		 502 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  39.51 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.25 
 
 		 486 aa  292  7e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1697  GTPase  40.67 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.83128e-22 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  41.13 
 
 		 503 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  41.56 
 
 		 521 aa  288  9e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  40 
 
 		 517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  41 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  38.52 
 
 		 501 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  37.64 
 
 		 512 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  37.5 
 
 		 485 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  38.85 
 
 		 553 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  39.42 
 
 		 522 aa  276  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  39.75 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  40.29 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  41.74 
 
 		 414 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  38.93 
 
 		 494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  42.04 
 
 		 515 aa  273  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  37.2 
 
 		 530 aa  272  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.43 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  40.41 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  40.95 
 
 		 505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  38.61 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  39.2 
 
 		 420 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  39.79 
 
 		 479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  37.61 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  37.41 
 
 		 493 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  38.52 
 
 		 445 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  37.32 
 
 		 442 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  37.17 
 
 		 487 aa  262  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  40.69 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  37.2 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  41.91 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  37.16 
 
 		 546 aa  260  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  37.82 
 
 		 582 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  37.59 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  41.46 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  40.97 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  41.46 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  37.27 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  37.65 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  40.2 
 
 		 524 aa  257  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  40.7 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  39.24 
 
 		 415 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  37.88 
 
 		 515 aa  257  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  40.7 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  38.38 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  36.75 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  37.53 
 
 		 484 aa  256  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  38.72 
 
 		 493 aa  255  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  37.5 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  40.43 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  42.06 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  41.18 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  41.46 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  36.34 
 
 		 501 aa  254  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  39.7 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  40.9 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  38.56 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  40.72 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  36.34 
 
 		 597 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  37.25 
 
 		 495 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  41.86 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  43.44 
 
 		 405 aa  253  7e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  38.11 
 
 		 494 aa  252  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  36.34 
 
 		 597 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  36.45 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  35.86 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  44.05 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  38.44 
 
 		 421 aa  250  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  38.79 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  38.27 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  36.21 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  36.04 
 
 		 444 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  36.48 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  39.55 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  37.62 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  43.9 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  40.45 
 
 		 433 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  39.29 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  39.06 
 
 		 596 aa  246  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  36.93 
 
 		 450 aa  245  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  40.21 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  34.93 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>