More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4111 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 425 aa  847    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0587  GTP-binding proten HflX  47.86 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  47.8 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  44.77 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.81 
 
 		 454 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.21 
 
 		 461 aa  316  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.01 
 
 		 454 aa  316  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.24 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  41.99 
 
 		 433 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  42.79 
 
 		 502 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  42.99 
 
 		 436 aa  300  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  41.94 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  42.07 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  43.97 
 
 		 485 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  43.84 
 
 		 503 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  41.42 
 
 		 421 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  42.17 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  43.93 
 
 		 479 aa  293  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  41.28 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  38.79 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  42.09 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  42.09 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  41.5 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  45.07 
 
 		 495 aa  290  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  43.78 
 
 		 439 aa  288  9e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  43.61 
 
 		 521 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  42.82 
 
 		 509 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  41.98 
 
 		 450 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  41.9 
 
 		 582 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  41.46 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  42.51 
 
 		 515 aa  283  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  40.53 
 
 		 433 aa  282  9e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  42.56 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2750  GTP-binding protein HflX, truncation  46.47 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.33 
 
 		 493 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  42.56 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  42.56 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  44.68 
 
 		 482 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  43.41 
 
 		 493 aa  280  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  43.37 
 
 		 435 aa  279  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  42.6 
 
 		 417 aa  279  8e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  39.81 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  40.05 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.26 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  42.92 
 
 		 483 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  43.33 
 
 		 505 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  42.69 
 
 		 483 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  41.49 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  42.69 
 
 		 483 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  41.89 
 
 		 489 aa  276  4e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  44.72 
 
 		 501 aa  276  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  41.79 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  41.78 
 
 		 482 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  41.89 
 
 		 489 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  43.65 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.58 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  41.1 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  41.09 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  41.62 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  46.61 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  41.13 
 
 		 429 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  41.98 
 
 		 430 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  41.29 
 
 		 512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.48 
 
 		 486 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  39.15 
 
 		 421 aa  273  5.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  44.13 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  44.13 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  40.97 
 
 		 481 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  42.22 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  43.88 
 
 		 435 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  41.81 
 
 		 441 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  41.12 
 
 		 444 aa  272  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  41.94 
 
 		 428 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  41.94 
 
 		 428 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  43.33 
 
 		 553 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  43.99 
 
 		 494 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  42.48 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.45 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  41.69 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  42.6 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  40.74 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  43.75 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  43.88 
 
 		 482 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  41.84 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  41.39 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  45.71 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  42.75 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  41.21 
 
 		 414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4941  GTP-binding protein HflX  42.89 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  48.73 
 
 		 403 aa  269  7e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  40.66 
 
 		 487 aa  269  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  38.46 
 
 		 413 aa  269  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  40.61 
 
 		 484 aa  269  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  36.93 
 
 		 519 aa  269  8e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  43.48 
 
 		 429 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  43.88 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  48.1 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  42.04 
 
 		 515 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  42.4 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  41.29 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>