More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0590 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 396 aa  807    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  62.73 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  57.88 
 
 		 406 aa  461  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  57.81 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  56.78 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  55.81 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  55 
 
 		 426 aa  431  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  54.66 
 
 		 411 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  56.2 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  52.88 
 
 		 395 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  52.6 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  51.98 
 
 		 434 aa  362  6e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  48.95 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  49.48 
 
 		 434 aa  345  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  53.58 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  48.95 
 
 		 433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  48.02 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  47.49 
 
 		 434 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  49.69 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  43.03 
 
 		 461 aa  299  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  46.57 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  50.62 
 
 		 421 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.32 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  47.17 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  49.83 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  49.5 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  49.83 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  49.5 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  49.5 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  51.57 
 
 		 413 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  49.16 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  48.55 
 
 		 432 aa  289  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  49.16 
 
 		 396 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  49.83 
 
 		 392 aa  289  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  48.83 
 
 		 396 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  48.83 
 
 		 414 aa  288  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  49.83 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  49.83 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  49.83 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  49.83 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  49.83 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  47.42 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  47.83 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  49.5 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  48.16 
 
 		 437 aa  286  4e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  49.5 
 
 		 387 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  47.08 
 
 		 419 aa  285  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  48.11 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  46.77 
 
 		 419 aa  285  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.26 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  46.77 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  46.77 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  48.21 
 
 		 422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  46.46 
 
 		 419 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  45.29 
 
 		 403 aa  282  9e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  46.15 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  46.77 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  46.15 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  47.13 
 
 		 502 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  41.56 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  46.62 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  46.62 
 
 		 435 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  45.85 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  45.85 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  47.08 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  48.31 
 
 		 417 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  47.85 
 
 		 454 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  48.46 
 
 		 414 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  47.17 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  47.03 
 
 		 403 aa  279  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  51.08 
 
 		 582 aa  279  8e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  41.3 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  46.18 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  41.47 
 
 		 414 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  46.11 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  46.08 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  46.08 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  46.08 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  42.34 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  41.47 
 
 		 414 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  39.57 
 
 		 553 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  46.71 
 
 		 429 aa  275  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.57 
 
 		 433 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  47.57 
 
 		 441 aa  275  9e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.89 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  46.2 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  42.12 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  46.43 
 
 		 482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  44.55 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  46.67 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  46.96 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  43.87 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  47.28 
 
 		 435 aa  272  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  47 
 
 		 439 aa  272  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  46.96 
 
 		 435 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  46.96 
 
 		 435 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  46.96 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  46.67 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  44.2 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  40 
 
 		 489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>