More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0751 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0751  GTP-binding protein HflX  100 
 
 		 443 aa  894    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2390  GTP-binding protein, HSR1-related  62.67 
 
 		 443 aa  552  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.817457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2456  putative GTP-binding protein HflX  54.02 
 
 		 455 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1914  putative GTP-binding protein  54.17 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.270348  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2232  GTP-binding proten HflX  45.66 
 
 		 450 aa  349  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1363  putative GTP-binding protein  43.45 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3241  GTP-binding proten HflX  41.95 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2720  GTP-binding protein, HSR1-related  41.63 
 
 		 468 aa  293  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4350  GTP-binding proten HflX  38.59 
 
 		 488 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.312302  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  39.04 
 
 		 436 aa  254  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  37.94 
 
 		 433 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  38.05 
 
 		 437 aa  249  6e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  36.34 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  38.27 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  36.09 
 
 		 435 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  36.65 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  35.78 
 
 		 434 aa  236  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  39.76 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  37.53 
 
 		 512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  37.91 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  36.63 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  41.03 
 
 		 561 aa  232  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  35.56 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  35.32 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  36.73 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  35.6 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  35.14 
 
 		 509 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  34.72 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.22 
 
 		 493 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  33.03 
 
 		 431 aa  226  6e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  36.36 
 
 		 521 aa  226  7e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  33.1 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  37.04 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  36.21 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  36.69 
 
 		 553 aa  223  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  36.14 
 
 		 487 aa  222  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.77 
 
 		 486 aa  222  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  37.41 
 
 		 530 aa  222  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  37.41 
 
 		 515 aa  223  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  38.29 
 
 		 515 aa  222  9e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  34.89 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  37.06 
 
 		 546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  36.65 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  36.98 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  34.55 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  38.35 
 
 		 479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  35.17 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  41.23 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  35.55 
 
 		 596 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  36.3 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  39.41 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  34.02 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  37.39 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  36.57 
 
 		 493 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  35.4 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  41.18 
 
 		 493 aa  216  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  33.94 
 
 		 501 aa  216  9e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  35.19 
 
 		 517 aa  215  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  35.19 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  35.76 
 
 		 582 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  39.05 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  39.51 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  35.87 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  33.72 
 
 		 439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  32.23 
 
 		 406 aa  213  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  41.35 
 
 		 480 aa  213  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  37 
 
 		 380 aa  212  9e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  37.39 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  37.09 
 
 		 505 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  34.78 
 
 		 454 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  37.57 
 
 		 553 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  37.6 
 
 		 583 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  39.62 
 
 		 425 aa  210  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  37.86 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  38.52 
 
 		 564 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  35.96 
 
 		 403 aa  210  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  38.52 
 
 		 564 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  35.51 
 
 		 522 aa  210  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2750  GTP-binding protein HflX, truncation  37 
 
 		 391 aa  209  7e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  38.24 
 
 		 483 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  32.7 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  31.92 
 
 		 419 aa  209  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  37.94 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  35.01 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  38.17 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  37.94 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  38.82 
 
 		 482 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  32.73 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  33.18 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  35.22 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  30.3 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  34.61 
 
 		 432 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  39.16 
 
 		 519 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  33.64 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  32.8 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  34.47 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  40.17 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  32.94 
 
 		 415 aa  207  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  37.44 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>