More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2750 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2750  GTP-binding protein HflX, truncation  100 
 
 
391 aa  787    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  46.47 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  43.99 
 
 
442 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  44.51 
 
 
436 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  42.69 
 
 
441 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  43.12 
 
 
428 aa  250  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  43.28 
 
 
395 aa  250  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  42.64 
 
 
433 aa  249  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  39.18 
 
 
433 aa  249  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  42.29 
 
 
509 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  42.49 
 
 
395 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  41.16 
 
 
434 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  44.81 
 
 
401 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  44.81 
 
 
419 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  42.31 
 
 
553 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  44.81 
 
 
419 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  44.81 
 
 
419 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  44.81 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  43.86 
 
 
564 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  41.01 
 
 
435 aa  243  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  43.86 
 
 
564 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  44.48 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  44.48 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  41.85 
 
 
450 aa  242  7e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  44.19 
 
 
406 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  40.41 
 
 
441 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  43.83 
 
 
419 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  41.85 
 
 
434 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  43.18 
 
 
419 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  44.16 
 
 
419 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  39.48 
 
 
439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  41.54 
 
 
450 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  40.87 
 
 
528 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  42.69 
 
 
464 aa  238  9e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  41.45 
 
 
574 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  43.83 
 
 
421 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  40.53 
 
 
395 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  40.53 
 
 
395 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  44.48 
 
 
396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.98 
 
 
493 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  40.53 
 
 
396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  40.53 
 
 
396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  43.51 
 
 
419 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  41.21 
 
 
583 aa  235  8e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  43.6 
 
 
482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  40.24 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  43.35 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2100  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.69 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  42.06 
 
 
384 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  40.31 
 
 
401 aa  233  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  40.11 
 
 
493 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  41.19 
 
 
437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  40.24 
 
 
404 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  40.6 
 
 
433 aa  233  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  39.41 
 
 
421 aa  233  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  40.53 
 
 
392 aa  233  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  40.24 
 
 
404 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  39.41 
 
 
450 aa  232  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  43.77 
 
 
407 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  40.53 
 
 
387 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  40.53 
 
 
392 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  40.53 
 
 
387 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  40.53 
 
 
387 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  40.53 
 
 
387 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  37.63 
 
 
431 aa  231  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  41.59 
 
 
434 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  40.24 
 
 
414 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  40.53 
 
 
387 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  39.47 
 
 
430 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  39.94 
 
 
396 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  40.25 
 
 
433 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  40.25 
 
 
433 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  40.25 
 
 
433 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  40.85 
 
 
426 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  43.4 
 
 
422 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0587  GTP-binding proten HflX  49.64 
 
 
437 aa  230  4e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  40.24 
 
 
387 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  40.8 
 
 
454 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  39.17 
 
 
435 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  38.94 
 
 
426 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  41.1 
 
 
503 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  38.94 
 
 
426 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  41.21 
 
 
440 aa  229  9e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  38.62 
 
 
426 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  42.03 
 
 
553 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  41.91 
 
 
519 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  38.62 
 
 
426 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  38.62 
 
 
426 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  38.62 
 
 
426 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2080  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.23 
 
 
414 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  39.32 
 
 
433 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  38.62 
 
 
426 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  39.32 
 
 
433 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  38.62 
 
 
426 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  38.62 
 
 
426 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  38.62 
 
 
426 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  38.62 
 
 
426 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  40.26 
 
 
433 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  42.04 
 
 
517 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  39.59 
 
 
436 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>