More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0587 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0587  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
437 aa  887    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  48.81 
 
 
425 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  41.45 
 
 
441 aa  295  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  42.86 
 
 
454 aa  295  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  42.76 
 
 
454 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  41.86 
 
 
441 aa  289  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  44.01 
 
 
436 aa  286  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  41.2 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  38.57 
 
 
419 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  41.01 
 
 
433 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  41.71 
 
 
433 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  41.47 
 
 
433 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  42.93 
 
 
461 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  43.63 
 
 
422 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  43.19 
 
 
503 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  39.57 
 
 
415 aa  279  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  41.15 
 
 
442 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  41.01 
 
 
421 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  40.74 
 
 
433 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  39.04 
 
 
509 aa  276  7e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  40.38 
 
 
432 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  40.73 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.16 
 
 
486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  40.96 
 
 
429 aa  274  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  40.57 
 
 
433 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  40.57 
 
 
433 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  40.57 
 
 
433 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  40.57 
 
 
439 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  42.64 
 
 
464 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2750  GTP-binding protein HflX, truncation  51.43 
 
 
391 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.07 
 
 
419 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  40.24 
 
 
502 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  40.37 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  37.76 
 
 
419 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  40.28 
 
 
485 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  37.84 
 
 
419 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  37.84 
 
 
419 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  37.84 
 
 
419 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  37.84 
 
 
419 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  39.81 
 
 
430 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  37.84 
 
 
419 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  37.96 
 
 
419 aa  267  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  37.61 
 
 
419 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  37.61 
 
 
419 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  39.95 
 
 
435 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  42.82 
 
 
450 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  41.01 
 
 
582 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  42.17 
 
 
429 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  45.05 
 
 
431 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  41.71 
 
 
429 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  38.24 
 
 
395 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  41.87 
 
 
429 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  39.5 
 
 
435 aa  263  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  41.93 
 
 
429 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  40.72 
 
 
440 aa  262  8e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0658  GTP-binding protein HflX  45.89 
 
 
447 aa  261  2e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  40.09 
 
 
420 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.48 
 
 
493 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  38.89 
 
 
395 aa  261  2e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  43.55 
 
 
519 aa  261  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  38.69 
 
 
435 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  41.69 
 
 
479 aa  261  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  40.05 
 
 
436 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  43.16 
 
 
401 aa  260  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  40.29 
 
 
414 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  37.79 
 
 
484 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.2 
 
 
436 aa  259  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  40.5 
 
 
428 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  39.48 
 
 
432 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1093  GTP-binding proten HflX  40.73 
 
 
438 aa  257  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000358907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  39.68 
 
 
426 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  40.18 
 
 
597 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  40.67 
 
 
439 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  39.44 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  46.13 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  39.72 
 
 
597 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  37.77 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  45.76 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  38.93 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  41.2 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  40.75 
 
 
512 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  39.67 
 
 
494 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  40.97 
 
 
483 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  44.91 
 
 
426 aa  252  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  40.97 
 
 
483 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  39.72 
 
 
426 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  38.89 
 
 
426 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  38.89 
 
 
426 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  38.89 
 
 
426 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  44.01 
 
 
435 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  38.89 
 
 
426 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  38.89 
 
 
426 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  38.66 
 
 
426 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  38.66 
 
 
426 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  38.66 
 
 
426 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  43.71 
 
 
396 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  43.95 
 
 
392 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  38.66 
 
 
426 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  38.66 
 
 
426 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  38.66 
 
 
426 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>