More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0658 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0658  GTP-binding protein HflX  100 
 
 
447 aa  910    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  44.68 
 
 
433 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  42.28 
 
 
434 aa  297  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  43.53 
 
 
395 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  42.25 
 
 
441 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  44.3 
 
 
434 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  43.19 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  40.34 
 
 
454 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  39.9 
 
 
444 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  40.83 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  40.49 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  44.15 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  43.58 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  43.17 
 
 
435 aa  279  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  46.35 
 
 
432 aa  279  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  43.77 
 
 
464 aa  277  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  42.97 
 
 
433 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  42.09 
 
 
421 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  41.73 
 
 
426 aa  275  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  41.1 
 
 
425 aa  275  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  39.75 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  41.73 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  44.64 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  38.96 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  38.31 
 
 
433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  44.75 
 
 
450 aa  273  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  41.12 
 
 
441 aa  273  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  42.62 
 
 
426 aa  272  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  38.27 
 
 
413 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  46.25 
 
 
395 aa  272  9e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  40.71 
 
 
436 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  41.73 
 
 
414 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  47 
 
 
401 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  45.51 
 
 
450 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  39.95 
 
 
429 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  40.58 
 
 
479 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  48.7 
 
 
396 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  45.45 
 
 
519 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  45.1 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  45.1 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  39.37 
 
 
420 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.03 
 
 
417 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  38.78 
 
 
509 aa  266  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  40.15 
 
 
426 aa  266  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.06 
 
 
441 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  44.21 
 
 
414 aa  266  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  40.8 
 
 
430 aa  266  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.39 
 
 
582 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  40.15 
 
 
426 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  39.9 
 
 
426 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  40.15 
 
 
426 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  40.45 
 
 
433 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  39.9 
 
 
426 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  40.15 
 
 
426 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  40.15 
 
 
426 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  39.9 
 
 
426 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  40.15 
 
 
426 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  40.15 
 
 
426 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  39.9 
 
 
426 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  40.15 
 
 
426 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  39.9 
 
 
426 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  41.4 
 
 
471 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  44.81 
 
 
392 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  41.21 
 
 
433 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  39.9 
 
 
426 aa  263  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.74 
 
 
436 aa  262  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  40.1 
 
 
426 aa  262  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 
392 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  44.51 
 
 
387 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  40.41 
 
 
445 aa  262  8e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  43.68 
 
 
406 aa  262  8.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  43.92 
 
 
396 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  42.78 
 
 
421 aa  262  8.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 
387 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 
387 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  38.6 
 
 
419 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 
387 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  44.51 
 
 
387 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  38.6 
 
 
419 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  38.35 
 
 
419 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  41.54 
 
 
422 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  44.21 
 
 
387 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  43.92 
 
 
396 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  38.6 
 
 
419 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  43.92 
 
 
395 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  38.6 
 
 
419 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  43.92 
 
 
396 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  38.35 
 
 
419 aa  261  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  43.92 
 
 
395 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  43.62 
 
 
396 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  40.25 
 
 
428 aa  260  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  40.25 
 
 
428 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  41.94 
 
 
432 aa  260  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  42.41 
 
 
471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  38.6 
 
 
419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  42.41 
 
 
471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  38.6 
 
 
419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  39.69 
 
 
426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  38.85 
 
 
419 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  46.11 
 
 
407 aa  259  8e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>