More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1914 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2456  putative GTP-binding protein HflX  81.54 
 
 		 455 aa  731    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1914  putative GTP-binding protein  100 
 
 		 453 aa  922    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.270348  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2390  GTP-binding protein, HSR1-related  55.78 
 
 		 443 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.817457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0751  GTP-binding protein HflX  54.63 
 
 		 443 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2232  GTP-binding proten HflX  50.9 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3241  GTP-binding proten HflX  45.41 
 
 		 447 aa  343  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1363  putative GTP-binding protein  46.34 
 
 		 458 aa  330  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2720  GTP-binding protein, HSR1-related  45.48 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4350  GTP-binding proten HflX  41.46 
 
 		 488 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.312302  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  37.71 
 
 		 442 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  39.36 
 
 		 395 aa  253  6e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  36.67 
 
 		 421 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  36.3 
 
 		 485 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  39.79 
 
 		 396 aa  239  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  36.63 
 
 		 482 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  35.7 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  40.24 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  41.69 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  36.64 
 
 		 437 aa  236  8e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  35.7 
 
 		 441 aa  236  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  38.42 
 
 		 411 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  37.29 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  36.24 
 
 		 502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  35.13 
 
 		 419 aa  233  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  35.81 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  35.54 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  34.72 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  34.72 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  34.72 
 
 		 419 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  40.86 
 
 		 406 aa  229  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  34.49 
 
 		 419 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  34.43 
 
 		 419 aa  229  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  34.49 
 
 		 419 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.8 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  34.81 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  36.43 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  35.16 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  35.81 
 
 		 521 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  34.41 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  34.26 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  36.2 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  35.32 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  35.7 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  35.66 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  34.46 
 
 		 406 aa  225  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  39.46 
 
 		 561 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  34.53 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  34.5 
 
 		 509 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  36.59 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  34.4 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  36.28 
 
 		 425 aa  223  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  34.45 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  35.96 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  36.3 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  36.94 
 
 		 553 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  37.97 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  34.62 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  36.41 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  38.76 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  35.68 
 
 		 501 aa  221  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  35.91 
 
 		 553 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  39.44 
 
 		 429 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  36.59 
 
 		 487 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  36.3 
 
 		 432 aa  220  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  35.34 
 
 		 493 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  34.9 
 
 		 435 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  35.57 
 
 		 503 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  33.57 
 
 		 512 aa  219  7e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  35.8 
 
 		 530 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  34.54 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  36.14 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  34.22 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  40.94 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  37.25 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  34.02 
 
 		 546 aa  217  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  36.7 
 
 		 425 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  35.45 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  34.68 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  35.73 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  37.12 
 
 		 421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  34.17 
 
 		 522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  35 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  35.9 
 
 		 417 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  37.11 
 
 		 528 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  37.65 
 
 		 519 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  37.14 
 
 		 549 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  42.77 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  34.61 
 
 		 435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  39.38 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0580  GTP-binding protein hflX  34.9 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  35.96 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  35.66 
 
 		 454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  34.98 
 
 		 435 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  35.12 
 
 		 517 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  34.66 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  35.19 
 
 		 505 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  34.03 
 
 		 428 aa  213  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  38.2 
 
 		 414 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  38.96 
 
 		 490 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  36.99 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>