More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2390 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2390  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 443 aa  904    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.817457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0751  GTP-binding protein HflX  62.67 
 
 		 443 aa  552  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2456  putative GTP-binding protein HflX  55.65 
 
 		 455 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1914  putative GTP-binding protein  55.78 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.270348  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2232  GTP-binding proten HflX  47.99 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3241  GTP-binding proten HflX  44.87 
 
 		 447 aa  332  7.000000000000001e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2720  GTP-binding protein, HSR1-related  44.08 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1363  putative GTP-binding protein  43.94 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4350  GTP-binding proten HflX  40.34 
 
 		 488 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.312302  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  41.19 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  38.99 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  40.42 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  36.01 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  37.61 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  37.07 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  35.7 
 
 		 414 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  35.15 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  36.64 
 
 		 485 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  37.44 
 
 		 487 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.88 
 
 		 493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  35.75 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  36.45 
 
 		 482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  34.92 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  33.81 
 
 		 421 aa  232  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  36.59 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  36.26 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  34.91 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  35.12 
 
 		 435 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  35.05 
 
 		 512 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  34.55 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  36.53 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  34.92 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  34.3 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  37.38 
 
 		 441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  36.26 
 
 		 503 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  37.24 
 
 		 425 aa  225  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  34.3 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  37.03 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  40.83 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  35.87 
 
 		 596 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  34.45 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  32.88 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  34.91 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  33.99 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  36.12 
 
 		 461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  36.51 
 
 		 530 aa  223  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  34.81 
 
 		 512 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  41.23 
 
 		 597 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  41 
 
 		 406 aa  222  8e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  43.33 
 
 		 608 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  42.51 
 
 		 607 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  35.76 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  41.92 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  41.23 
 
 		 597 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  42.51 
 
 		 607 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  38.78 
 
 		 561 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  35.59 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  34.9 
 
 		 454 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  34.57 
 
 		 484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  38.48 
 
 		 528 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  36.19 
 
 		 493 aa  220  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  36.82 
 
 		 515 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  35.82 
 
 		 435 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  35.17 
 
 		 553 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  35.05 
 
 		 450 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  37.74 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  34.98 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  36.78 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  37.68 
 
 		 466 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0343  GTP-binding proten HflX  37.57 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.035256  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  38.89 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  36.04 
 
 		 405 aa  216  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  37.67 
 
 		 412 aa  216  7e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  41.5 
 
 		 540 aa  216  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  40.29 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  34.87 
 
 		 433 aa  216  9e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  37.8 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  35.82 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  34.1 
 
 		 493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  35.17 
 
 		 522 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  37.5 
 
 		 532 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  40.7 
 
 		 599 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  35.84 
 
 		 515 aa  213  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  35.39 
 
 		 582 aa  213  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1697  GTPase  34.07 
 
 		 429 aa  213  7e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.83128e-22 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  38.96 
 
 		 553 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  34.71 
 
 		 432 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  34.65 
 
 		 501 aa  213  7.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  35.66 
 
 		 432 aa  212  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  38.08 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  34.35 
 
 		 546 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.28 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  34.72 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  34.29 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  34.03 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  34.7 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  37.13 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  37.62 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  37.3 
 
 		 564 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  34.47 
 
 		 483 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>