More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0122 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 421 aa  840    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  52.39 
 
 		 406 aa  359  4e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  51.27 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  46.46 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  41.06 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  49.57 
 
 		 421 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.42 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  42.53 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  41.55 
 
 		 553 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  41.49 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  42.27 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  41.96 
 
 		 479 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.6 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  39.14 
 
 		 433 aa  286  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  43.5 
 
 		 493 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1759  small GTP-binding protein  50.57 
 
 		 361 aa  286  7e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000555556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  47.79 
 
 		 487 aa  285  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  37.23 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  43.25 
 
 		 437 aa  283  5.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  45.61 
 
 		 512 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  40.99 
 
 		 436 aa  282  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  40.14 
 
 		 485 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.07 
 
 		 486 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  43.35 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  43.09 
 
 		 384 aa  279  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  46.5 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.98 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  41.69 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 		 512 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  41.23 
 
 		 494 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  42.94 
 
 		 522 aa  275  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  41.03 
 
 		 530 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  42.2 
 
 		 444 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  43.02 
 
 		 515 aa  272  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  39.03 
 
 		 521 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  40.6 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  41.6 
 
 		 482 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  41.69 
 
 		 546 aa  269  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  41.05 
 
 		 435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  44.41 
 
 		 501 aa  269  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  43.3 
 
 		 420 aa  269  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  42.73 
 
 		 517 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  43.47 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  40.88 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  41.08 
 
 		 414 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  41.46 
 
 		 440 aa  267  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  43.3 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  43.18 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  43.3 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  43.18 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  43.3 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  43.3 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  39.15 
 
 		 425 aa  266  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  40.77 
 
 		 412 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  49.7 
 
 		 509 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  40.81 
 
 		 414 aa  266  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  47.45 
 
 		 395 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  37.83 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  43.02 
 
 		 387 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  40.21 
 
 		 483 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  37.74 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  46.35 
 
 		 596 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  40.34 
 
 		 435 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  42.33 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  39.11 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  40.17 
 
 		 433 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  38.78 
 
 		 419 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  39.95 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  42.54 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  39.95 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  41.76 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  42.86 
 
 		 421 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  41.76 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  40.17 
 
 		 433 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  41.76 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  37.62 
 
 		 501 aa  262  8e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  41.76 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  39.22 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  41.76 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  35.08 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  40.73 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  39.11 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  39.61 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  41.18 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  41.38 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  39.79 
 
 		 425 aa  260  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  40.54 
 
 		 435 aa  260  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  39.33 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  43.78 
 
 		 451 aa  260  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  43.87 
 
 		 540 aa  260  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  41.18 
 
 		 435 aa  260  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  38.41 
 
 		 493 aa  260  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  40.9 
 
 		 435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  40.06 
 
 		 433 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  39.33 
 
 		 426 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  37.26 
 
 		 419 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  40.06 
 
 		 433 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  42.29 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  42.29 
 
 		 404 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  40.06 
 
 		 433 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>