More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2720 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2720  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 468 aa  951    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1363  putative GTP-binding protein  75.76 
 
 		 458 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3241  GTP-binding proten HflX  81.31 
 
 		 447 aa  709    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2232  GTP-binding proten HflX  49.78 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1914  putative GTP-binding protein  45.27 
 
 		 453 aa  340  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.270348  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2390  GTP-binding protein, HSR1-related  44.55 
 
 		 443 aa  333  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.817457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2456  putative GTP-binding protein HflX  43.08 
 
 		 455 aa  322  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0751  GTP-binding protein HflX  42.79 
 
 		 443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4350  GTP-binding proten HflX  42.07 
 
 		 488 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.312302  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  43 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  40.67 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  40.69 
 
 		 442 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  42.62 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  41.98 
 
 		 431 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  39.81 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  40.71 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  42.38 
 
 		 494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  40.93 
 
 		 509 aa  253  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  40.1 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  38.63 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  40.14 
 
 		 435 aa  251  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  38.58 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  38.73 
 
 		 421 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  43.02 
 
 		 396 aa  250  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  35.88 
 
 		 419 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  41.39 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  42.6 
 
 		 401 aa  246  8e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.06 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  42.27 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  39.35 
 
 		 553 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  41.19 
 
 		 522 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  37.38 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  40.58 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  35.66 
 
 		 419 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  39.55 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  40.05 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  35.83 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  35.43 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  35.43 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  35.43 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  41.67 
 
 		 426 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  39.69 
 
 		 464 aa  243  7e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  37.89 
 
 		 412 aa  243  7e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  35.43 
 
 		 419 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  35.66 
 
 		 419 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  39.41 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  40.49 
 
 		 485 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  42.48 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.39 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  36.9 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  38.41 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  37.97 
 
 		 429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  39.95 
 
 		 428 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  41.67 
 
 		 521 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  39.59 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  40 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  35.2 
 
 		 419 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  36.34 
 
 		 401 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  38.79 
 
 		 517 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  38.52 
 
 		 503 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  40.97 
 
 		 512 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  39.34 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  34.82 
 
 		 419 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  41.73 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  42.26 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  39.26 
 
 		 489 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  42.42 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  42.57 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  42.57 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  41.67 
 
 		 546 aa  237  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  41.6 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  41.6 
 
 		 396 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  42.57 
 
 		 396 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  37.23 
 
 		 437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  40.53 
 
 		 501 aa  236  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  38.77 
 
 		 489 aa  236  6e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  42.29 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  40.24 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  41.16 
 
 		 530 aa  236  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  40.44 
 
 		 515 aa  236  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  42.34 
 
 		 392 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  35.98 
 
 		 433 aa  236  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  42.34 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  42.34 
 
 		 392 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  42.34 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  38.54 
 
 		 484 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  37.78 
 
 		 436 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  42.28 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  42.34 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  42.34 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  41.32 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  38.42 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  41.42 
 
 		 493 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  41.32 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  38.42 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  38.42 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  42.34 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  42.34 
 
 		 387 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  38.42 
 
 		 433 aa  233  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  37.68 
 
 		 428 aa  232  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>