More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1857 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  100 
 
 
433 aa  890    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  55.16 
 
 
425 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0155  GTPase  54.13 
 
 
437 aa  456  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  47.51 
 
 
419 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1697  GTPase  49.51 
 
 
429 aa  368  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  6.83128e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  44.63 
 
 
419 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  47.1 
 
 
419 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  44.73 
 
 
419 aa  359  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  45.67 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  44.5 
 
 
419 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  44.99 
 
 
419 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  44.26 
 
 
419 aa  354  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  44.99 
 
 
419 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  44.5 
 
 
419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  45.19 
 
 
419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  47.57 
 
 
401 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1093  GTP-binding proten HflX  40.88 
 
 
438 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000358907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  40.09 
 
 
413 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  38.44 
 
 
502 aa  275  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  38.72 
 
 
509 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  39.66 
 
 
421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  41.5 
 
 
420 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  38.04 
 
 
433 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  38.57 
 
 
435 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.31 
 
 
486 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  38.39 
 
 
441 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  39.29 
 
 
482 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.81 
 
 
493 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  40.53 
 
 
415 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  39.42 
 
 
582 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  39.76 
 
 
425 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  38.94 
 
 
414 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  39.52 
 
 
425 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  38.95 
 
 
437 aa  256  5e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  38.52 
 
 
444 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  38.62 
 
 
503 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  38.14 
 
 
485 aa  255  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  43.42 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  45.75 
 
 
354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  43.42 
 
 
425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.65 
 
 
436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  40.48 
 
 
596 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  40.15 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  45.24 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  39.9 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  43.42 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  39.05 
 
 
423 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  40.68 
 
 
435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  43.14 
 
 
425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  38.07 
 
 
414 aa  253  6e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  39.16 
 
 
517 aa  253  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  44.98 
 
 
406 aa  252  8.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  37.82 
 
 
441 aa  252  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  38.07 
 
 
414 aa  252  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  43.14 
 
 
425 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  39.95 
 
 
493 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  38.89 
 
 
512 aa  250  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  39.37 
 
 
420 aa  249  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1212  GTP-binding proten HflX  39.81 
 
 
412 aa  249  8e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  39.1 
 
 
461 aa  249  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.77 
 
 
434 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  39.35 
 
 
515 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  38.85 
 
 
422 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  37.29 
 
 
454 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  38.02 
 
 
401 aa  246  8e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  39.85 
 
 
501 aa  245  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  40.97 
 
 
515 aa  245  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  40.1 
 
 
395 aa  245  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  41.62 
 
 
415 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  36.25 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  37.07 
 
 
442 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  35.81 
 
 
436 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  41.3 
 
 
431 aa  244  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  36.5 
 
 
421 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  39.95 
 
 
522 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 
426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  38.24 
 
 
454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  41.47 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  36.65 
 
 
406 aa  243  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  37.12 
 
 
597 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  42.22 
 
 
433 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  42.9 
 
 
396 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  37.12 
 
 
597 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  37.26 
 
 
512 aa  243  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  39.89 
 
 
395 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  37.24 
 
 
546 aa  242  7.999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  41.83 
 
 
409 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  38.4 
 
 
433 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  37.38 
 
 
433 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  37.83 
 
 
553 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  36.02 
 
 
450 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  39.8 
 
 
524 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  36.41 
 
 
433 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  35.68 
 
 
429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  38.11 
 
 
412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  38.39 
 
 
428 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  46.01 
 
 
396 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  38.15 
 
 
433 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  36.54 
 
 
429 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  37.75 
 
 
458 aa  239  8e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>