More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2114 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
415 aa  851    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  73.85 
 
 
415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  63.35 
 
 
420 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  62.86 
 
 
423 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  62.14 
 
 
425 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  61.65 
 
 
425 aa  481  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  61.65 
 
 
425 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  61.41 
 
 
425 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  61.65 
 
 
425 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  61.17 
 
 
424 aa  477  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  60.92 
 
 
425 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  66.67 
 
 
354 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1365  GTP-binding protein, HSR1-related  50.5 
 
 
412 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0434116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1391  GTP-binding protein HSR1-related  50.5 
 
 
412 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0873  GTP-binding protein, putative  46.87 
 
 
416 aa  349  6e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  47.76 
 
 
412 aa  348  8e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  47.25 
 
 
412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  52.55 
 
 
414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  50.77 
 
 
421 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  51.41 
 
 
422 aa  332  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  50.26 
 
 
441 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  48.88 
 
 
553 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  50.51 
 
 
413 aa  319  6e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0228  GTPase  46.27 
 
 
414 aa  316  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.99 
 
 
436 aa  315  7e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  46.15 
 
 
444 aa  315  8e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  46.58 
 
 
419 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  46.88 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  53.42 
 
 
528 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  44.14 
 
 
509 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.87 
 
 
442 aa  310  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  44.58 
 
 
419 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  43.58 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  43.58 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  43.32 
 
 
419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  43.58 
 
 
419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  44.39 
 
 
461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  43.58 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  46.46 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  49.03 
 
 
583 aa  307  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  43.58 
 
 
419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  43.83 
 
 
419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  43.58 
 
 
419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  50.14 
 
 
564 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  50.14 
 
 
564 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  45.38 
 
 
401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  50.29 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  54.26 
 
 
425 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  50.42 
 
 
535 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  48.61 
 
 
574 aa  302  8.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  46.62 
 
 
521 aa  301  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.78 
 
 
493 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  45.82 
 
 
437 aa  299  6e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  45.26 
 
 
512 aa  298  9e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  47.26 
 
 
512 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  45.69 
 
 
502 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.51 
 
 
440 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  46.89 
 
 
503 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  45.91 
 
 
546 aa  293  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.14 
 
 
454 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  42.57 
 
 
419 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  45.5 
 
 
414 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  42.72 
 
 
522 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  45.24 
 
 
414 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  48.03 
 
 
493 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  43.14 
 
 
454 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  47.49 
 
 
433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  45.7 
 
 
517 aa  289  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  46.72 
 
 
482 aa  289  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  44.58 
 
 
434 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  44.85 
 
 
441 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.84 
 
 
582 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  43.56 
 
 
553 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  54.74 
 
 
509 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  41.92 
 
 
481 aa  286  4e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  41.86 
 
 
401 aa  286  4e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  47.16 
 
 
485 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  44.83 
 
 
515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  49.54 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  44.5 
 
 
515 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  42.93 
 
 
431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  44.64 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  46.9 
 
 
487 aa  282  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  45.2 
 
 
405 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  44.61 
 
 
426 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  44.13 
 
 
494 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  44.39 
 
 
433 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.9 
 
 
436 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  49.29 
 
 
395 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  43.07 
 
 
432 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  46.84 
 
 
409 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  46.29 
 
 
524 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  43.23 
 
 
407 aa  280  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  45.83 
 
 
421 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  43.5 
 
 
430 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  49.54 
 
 
433 aa  280  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0155  GTPase  41.18 
 
 
437 aa  280  5e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  43.67 
 
 
501 aa  280  5e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  45.29 
 
 
433 aa  280  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  42.82 
 
 
432 aa  279  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>