More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0228 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0228  GTPase  100 
 
 		 414 aa  840    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  57.25 
 
 		 412 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  57.25 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  46.77 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  47.03 
 
 		 415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1391  GTP-binding protein HSR1-related  45.43 
 
 		 412 aa  309  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1365  GTP-binding protein, HSR1-related  45.43 
 
 		 412 aa  309  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0434116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  44.99 
 
 		 423 aa  308  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  47.83 
 
 		 425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  47.83 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  47.28 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  47.55 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  47.28 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  47.28 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  47.28 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  50.3 
 
 		 354 aa  298  9e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0873  GTP-binding protein, putative  45.14 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  46.27 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  47.13 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  43.96 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  43.96 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  42.01 
 
 		 481 aa  281  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  46.52 
 
 		 441 aa  279  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  44.06 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  44.06 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  44.06 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  38.28 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  42.37 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  42.44 
 
 		 433 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  40.44 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  42.65 
 
 		 582 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  41.12 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  45.43 
 
 		 421 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  43.82 
 
 		 414 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.96 
 
 		 431 aa  272  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  43.82 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  41.67 
 
 		 553 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.29 
 
 		 493 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  45.74 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.63 
 
 		 419 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  42.11 
 
 		 441 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  43.68 
 
 		 407 aa  269  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  40.63 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  39.86 
 
 		 502 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.39 
 
 		 442 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  42.69 
 
 		 429 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  43.98 
 
 		 375 aa  266  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  41.16 
 
 		 425 aa  265  8.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  46.05 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  44.89 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  45.51 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  38.93 
 
 		 461 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  39.86 
 
 		 487 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  41.73 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  42.3 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  45.39 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  44.72 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  43.75 
 
 		 422 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  45.39 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  44.1 
 
 		 435 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  45.39 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  43.85 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  39.6 
 
 		 435 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  45.39 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  45.39 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  46.38 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.63 
 
 		 419 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  45.39 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  45.39 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  45.39 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  45.39 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  46.45 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  45.39 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  46.38 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  44.25 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  38.99 
 
 		 435 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  39.29 
 
 		 479 aa  262  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.63 
 
 		 419 aa  262  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.63 
 
 		 419 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  45.39 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  42.51 
 
 		 489 aa  262  8e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  45.07 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  41.05 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  41.05 
 
 		 419 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  37.74 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  42.51 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  38.23 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  44.48 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  45.07 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  40.37 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  39.1 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  39.1 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  43.77 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  43.41 
 
 		 444 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  38.85 
 
 		 512 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  40.38 
 
 		 482 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.74 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  39.52 
 
 		 521 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  45.72 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>