More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0252 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 442 aa  866    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  64.58 
 
 		 426 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  65.02 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  60.56 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  58.98 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  58.03 
 
 		 436 aa  428  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  57.14 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  56.66 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  58.37 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  56.42 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  58.54 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  56.52 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  57.62 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  56.53 
 
 		 466 aa  418  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  59.47 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  57.41 
 
 		 474 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  58.72 
 
 		 442 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  59.8 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  57.18 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.8 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  55.95 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  55.95 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  55.95 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  56.22 
 
 		 470 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  54.52 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  59.02 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  54.13 
 
 		 472 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  54.93 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  57.83 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  58.51 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  59.84 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  50.8 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  55.53 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  56.02 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  52.97 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  51.4 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  51.75 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  52 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  53.01 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  50.69 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  53.92 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  54.22 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  52.86 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.63 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.58 
 
 		 433 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  43.08 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  44.6 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  44.6 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  44.6 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  42.96 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  45.61 
 
 		 433 aa  302  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.98 
 
 		 454 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  44.99 
 
 		 450 aa  299  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  42.57 
 
 		 415 aa  297  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  46.12 
 
 		 428 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  43.91 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  44.99 
 
 		 450 aa  295  7e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  41.09 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  44.42 
 
 		 441 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45.61 
 
 		 436 aa  293  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.12 
 
 		 461 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  44.23 
 
 		 464 aa  293  6e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  42.14 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  45.41 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  44.72 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  44.96 
 
 		 433 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  43.33 
 
 		 440 aa  289  8e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  44.53 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.39 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  41.4 
 
 		 414 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  41.4 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  43.03 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  44.66 
 
 		 489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  44.66 
 
 		 489 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.36 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  45.43 
 
 		 382 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  44.96 
 
 		 426 aa  282  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4941  GTP-binding protein HflX  44.39 
 
 		 433 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  43.03 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  42.71 
 
 		 444 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0573  GTP-binding protein, HSR1-related  44.39 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  46.28 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  45.38 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  44.27 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  44.55 
 
 		 521 aa  280  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  44.27 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  42.48 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  42.48 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  46.91 
 
 		 426 aa  279  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  41.35 
 
 		 434 aa  279  8e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  44.74 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  44.74 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  44.74 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  44.74 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  46.41 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  44.74 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  44.74 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  44.74 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  44.74 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  42.93 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>