More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1212 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1212  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
412 aa  824    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.43 
 
 
419 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.53 
 
 
419 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  40.53 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.05 
 
 
419 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.05 
 
 
419 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.05 
 
 
419 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  39.81 
 
 
419 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  39.81 
 
 
419 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  39.57 
 
 
419 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  42.29 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  39.57 
 
 
419 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  39.56 
 
 
425 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  40.8 
 
 
442 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  39.67 
 
 
435 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  40.59 
 
 
434 aa  264  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  41.21 
 
 
401 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  45.76 
 
 
406 aa  256  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  43.34 
 
 
396 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  40.31 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  39.12 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  40 
 
 
553 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  37.56 
 
 
431 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  40.53 
 
 
413 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  38.58 
 
 
433 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  39.81 
 
 
433 aa  249  7e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  38.36 
 
 
441 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  37.8 
 
 
436 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  45.67 
 
 
401 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  46.33 
 
 
407 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  44.37 
 
 
426 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  46.05 
 
 
409 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  37.83 
 
 
444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.78 
 
 
493 aa  246  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  38.27 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  39.79 
 
 
464 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  41.07 
 
 
582 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  36.36 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  36.59 
 
 
435 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  37.69 
 
 
435 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  37.69 
 
 
435 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  37.44 
 
 
435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  39.3 
 
 
461 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  41.21 
 
 
421 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  39.03 
 
 
437 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  37.6 
 
 
489 aa  238  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  36.59 
 
 
441 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  37.6 
 
 
489 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  37.24 
 
 
487 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  39.78 
 
 
433 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  35.71 
 
 
435 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  36.18 
 
 
435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  39.78 
 
 
433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  38.06 
 
 
411 aa  235  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  37.98 
 
 
417 aa  235  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  37.25 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  37.2 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  43.75 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  42.41 
 
 
596 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  37.23 
 
 
432 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  35.37 
 
 
502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  36.68 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  42.16 
 
 
395 aa  233  5e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  37.94 
 
 
426 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
426 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
426 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
426 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
426 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
426 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  38.84 
 
 
426 aa  232  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  37.67 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  37.67 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  35.49 
 
 
429 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  37.53 
 
 
481 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  37.67 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  35.41 
 
 
482 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  37.37 
 
 
433 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  36.67 
 
 
439 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  42.73 
 
 
532 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  36.94 
 
 
517 aa  230  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  44.48 
 
 
396 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  35.93 
 
 
435 aa  229  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  36.18 
 
 
435 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  36.18 
 
 
435 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  35.93 
 
 
435 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  40.69 
 
 
564 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  35.93 
 
 
435 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  40.69 
 
 
564 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  36.39 
 
 
429 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  36.95 
 
 
430 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  40.36 
 
 
395 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  35.84 
 
 
432 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  36.07 
 
 
428 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  36.65 
 
 
501 aa  226  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  41.09 
 
 
412 aa  225  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>