More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4350 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4350  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 488 aa  954    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.312302  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2232  GTP-binding proten HflX  44.42 
 
 		 450 aa  325  9e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3241  GTP-binding proten HflX  42.39 
 
 		 447 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1914  putative GTP-binding protein  40.8 
 
 		 453 aa  312  7.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.270348  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2390  GTP-binding protein, HSR1-related  40.46 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.817457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2720  GTP-binding protein, HSR1-related  41.95 
 
 		 468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2456  putative GTP-binding protein HflX  40.71 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1363  putative GTP-binding protein  42.28 
 
 		 458 aa  297  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0751  GTP-binding protein HflX  39.33 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  42.72 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  39.22 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  38.99 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  39.17 
 
 		 431 aa  224  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  39.55 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  36.32 
 
 		 519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  44.71 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  31.6 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  39.07 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  41.72 
 
 		 503 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  36.31 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  41.01 
 
 		 421 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  46.06 
 
 		 401 aa  215  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  45.12 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  41.21 
 
 		 435 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  33.33 
 
 		 433 aa  213  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.39 
 
 		 493 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  40.29 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  35.48 
 
 		 420 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  39.33 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  44.26 
 
 		 409 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  39.38 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  37.54 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  41.54 
 
 		 436 aa  206  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  45.91 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  36.39 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  41.64 
 
 		 414 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  37.12 
 
 		 419 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0343  GTP-binding proten HflX  39.93 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.035256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  36.89 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  37.73 
 
 		 419 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  37.73 
 
 		 419 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  37.73 
 
 		 419 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  43.28 
 
 		 426 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  44.94 
 
 		 411 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  42.43 
 
 		 422 aa  203  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  37.73 
 
 		 419 aa  203  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  37.73 
 
 		 419 aa  203  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  37.73 
 
 		 419 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  37.73 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  39.63 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  31.12 
 
 		 421 aa  201  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  36.69 
 
 		 429 aa  200  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  38.62 
 
 		 429 aa  200  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  44.9 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45.15 
 
 		 436 aa  200  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  40.58 
 
 		 464 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.9 
 
 		 486 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  36.15 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  37.5 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  37.9 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  36.92 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  44.49 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  35.28 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0155  GTPase  36.18 
 
 		 437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  39.64 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  41.64 
 
 		 485 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  35.36 
 
 		 512 aa  197  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  36.15 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  43.09 
 
 		 407 aa  196  7e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  45.59 
 
 		 421 aa  196  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  44.44 
 
 		 528 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  45.15 
 
 		 493 aa  196  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  38.86 
 
 		 441 aa  196  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  43.67 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  43.67 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  34.63 
 
 		 405 aa  196  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  39.26 
 
 		 512 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  42.38 
 
 		 515 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  41.07 
 
 		 417 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  42.45 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2750  GTP-binding protein HflX, truncation  37.67 
 
 		 391 aa  195  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  35.53 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  35.31 
 
 		 413 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  40.12 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  44.25 
 
 		 583 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  37.83 
 
 		 501 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  39.81 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  38.25 
 
 		 412 aa  193  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  40.6 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  45.38 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  40 
 
 		 401 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  40.61 
 
 		 553 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  39.13 
 
 		 512 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  38.25 
 
 		 597 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  42.59 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  38.3 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  42.91 
 
 		 535 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0580  GTP-binding protein hflX  43.95 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  39.48 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  38.01 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>