More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1363 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3241  GTP-binding proten HflX  74.57 
 
 		 447 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2720  GTP-binding protein, HSR1-related  77.24 
 
 		 468 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1363  putative GTP-binding protein  100 
 
 		 458 aa  926    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2232  GTP-binding proten HflX  49.03 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1914  putative GTP-binding protein  45.71 
 
 		 453 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.270348  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2390  GTP-binding protein, HSR1-related  45.52 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.817457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2456  putative GTP-binding protein HflX  42.95 
 
 		 455 aa  327  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0751  GTP-binding protein HflX  44.01 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4350  GTP-binding proten HflX  41.98 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.312302  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  38.21 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  37.47 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  35.92 
 
 		 435 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  38.32 
 
 		 431 aa  251  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  38.36 
 
 		 413 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  38.44 
 
 		 421 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  38.71 
 
 		 434 aa  249  8e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  39.76 
 
 		 509 aa  247  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  42.27 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  39.3 
 
 		 406 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  42.9 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  36.94 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  38.57 
 
 		 412 aa  243  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  37.41 
 
 		 489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  38.14 
 
 		 434 aa  243  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.3 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.8 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  36.26 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  36.36 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  35.02 
 
 		 419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  38.48 
 
 		 412 aa  240  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  37.79 
 
 		 420 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  40.99 
 
 		 429 aa  239  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  39.63 
 
 		 494 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  36.67 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  34.1 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  38.98 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  38.61 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  37.32 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  37.93 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  34.47 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  34.47 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  38.89 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  36.74 
 
 		 439 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  38.04 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  38.12 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  38.62 
 
 		 482 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  42.15 
 
 		 406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  41.4 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  34.47 
 
 		 419 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  34.25 
 
 		 419 aa  236  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  37.29 
 
 		 433 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  39.81 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  34.25 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  34.25 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  39.9 
 
 		 530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  35.03 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  40.05 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  43.21 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  34.47 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  39.19 
 
 		 512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  39.81 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  41.32 
 
 		 515 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  44.01 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  38.22 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  35 
 
 		 435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  34.02 
 
 		 419 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  35.76 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  36.47 
 
 		 425 aa  233  6e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  37.33 
 
 		 433 aa  233  7.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  38.71 
 
 		 553 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  36.05 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  36.05 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  35.97 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  39.29 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  39.3 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  37.29 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  37.29 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  35.51 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  38.59 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  36.94 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  37.29 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  35.52 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  39.95 
 
 		 546 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  39.08 
 
 		 421 aa  230  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  37.53 
 
 		 432 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  38.04 
 
 		 487 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  40.61 
 
 		 426 aa  229  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  41.42 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  36.47 
 
 		 435 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1697  GTPase  36.08 
 
 		 429 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.83128e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  36.43 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  40.61 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  38.21 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  42.07 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  37.47 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  40.3 
 
 		 392 aa  228  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  35.9 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  36.19 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.1 
 
 		 486 aa  226  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  36.19 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>