168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_09451 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  91.78 
 
 
499 aa  888    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  100 
 
 
499 aa  979    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  94.78 
 
 
499 aa  927    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  64.63 
 
 
496 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  38.25 
 
 
516 aa  362  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  35.56 
 
 
532 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  37.5 
 
 
517 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.5 
 
 
517 aa  316  7e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.49 
 
 
529 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  35.29 
 
 
529 aa  306  7e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.04 
 
 
517 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  36.5 
 
 
506 aa  286  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  36.86 
 
 
531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  36.86 
 
 
531 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  33.12 
 
 
529 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  34.29 
 
 
520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.66 
 
 
513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  36.21 
 
 
545 aa  273  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  24.82 
 
 
492 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  22.81 
 
 
481 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.96 
 
 
440 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  21.36 
 
 
472 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  26.93 
 
 
453 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  23.33 
 
 
471 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.36 
 
 
440 aa  104  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  25.87 
 
 
489 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.62 
 
 
472 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  26 
 
 
484 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  31.41 
 
 
440 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  25.62 
 
 
566 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  26.82 
 
 
462 aa  97.8  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.07 
 
 
431 aa  96.7  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.26 
 
 
492 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  25.4 
 
 
475 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  23.44 
 
 
475 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.37 
 
 
457 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  25.67 
 
 
448 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  25.67 
 
 
448 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  24.7 
 
 
479 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  24.7 
 
 
479 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  21.55 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  22 
 
 
463 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  23.13 
 
 
463 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  24.56 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  26.09 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  26.21 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  23.49 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  25.75 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  26.62 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.38 
 
 
413 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  25.71 
 
 
289 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.41 
 
 
413 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  32.61 
 
 
184 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  29.82 
 
 
451 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0915  small GTP-binding protein  31.88 
 
 
184 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.793666  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  34.13 
 
 
297 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  29.82 
 
 
451 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0947  small GTP-binding protein  32.86 
 
 
184 aa  54.3  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.445595  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  26.09 
 
 
454 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1766  small GTP-binding protein  32.61 
 
 
184 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  25.21 
 
 
306 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  29.51 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  29 
 
 
435 aa  52.4  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  32.09 
 
 
301 aa  52.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  25 
 
 
298 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  25 
 
 
461 aa  51.6  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  29.8 
 
 
303 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  25.21 
 
 
409 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  24.02 
 
 
300 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  24.5 
 
 
462 aa  50.1  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  30.53 
 
 
314 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  23.68 
 
 
312 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  27.74 
 
 
297 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  30 
 
 
452 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  28.48 
 
 
305 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  26.61 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  27.87 
 
 
308 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  26.82 
 
 
297 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  30.07 
 
 
310 aa  48.5  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  24.82 
 
 
300 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  29.17 
 
 
311 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  27.04 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  29.17 
 
 
311 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  28.5 
 
 
303 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  29.37 
 
 
318 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  31.75 
 
 
303 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  29.37 
 
 
320 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.74 
 
 
405 aa  47.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.27 
 
 
402 aa  47.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  30.1 
 
 
365 aa  47.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  28.48 
 
 
408 aa  47.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  26 
 
 
460 aa  47.8  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  27.64 
 
 
303 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  27.04 
 
 
299 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  27.04 
 
 
299 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  27.89 
 
 
454 aa  47.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  27.15 
 
 
307 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  33.07 
 
 
290 aa  47  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62149  predicted protein  31.09 
 
 
625 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127466  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  27.14 
 
 
303 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>