More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1709 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 513 aa  999    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  62.18 
 
 		 517 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  61.12 
 
 		 529 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  60.29 
 
 		 506 aa  589  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  62.13 
 
 		 531 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  61.72 
 
 		 531 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  58.91 
 
 		 545 aa  548  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  57.84 
 
 		 520 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  49.52 
 
 		 532 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  49.77 
 
 		 529 aa  415  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.53 
 
 		 529 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  49.07 
 
 		 516 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  44.39 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.04 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  33.89 
 
 		 499 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  34.66 
 
 		 499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  33.01 
 
 		 496 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.86 
 
 		 499 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  28.35 
 
 		 471 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  29.91 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  26.88 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  30.04 
 
 		 566 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  29.55 
 
 		 475 aa  160  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.58 
 
 		 472 aa  160  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  26.45 
 
 		 481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  25.79 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  29.58 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  25.11 
 
 		 463 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  29.21 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  27.99 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  29.85 
 
 		 489 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  27.99 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  29 
 
 		 475 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  28.01 
 
 		 462 aa  133  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.63 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  27.42 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  28.47 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.24 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  30.3 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  27.79 
 
 		 484 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  31.86 
 
 		 420 aa  120  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.35 
 
 		 431 aa  119  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  26.81 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.16 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.16 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  29.13 
 
 		 440 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  31.91 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  21.28 
 
 		 413 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.5 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.58 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  22.34 
 
 		 413 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  32.35 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  31.85 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  33.04 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  26.29 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  26.29 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  30.4 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  29.45 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  37.12 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  30.54 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  29.19 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  30.15 
 
 		 308 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  30.65 
 
 		 297 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  30.85 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  32.8 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.67 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  34.88 
 
 		 416 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  34.38 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  36.53 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  31.91 
 
 		 408 aa  55.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  24.75 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  28.57 
 
 		 290 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  34.15 
 
 		 468 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 		 338 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  24.09 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 		 338 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  31.03 
 
 		 461 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 		 338 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 		 338 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  30 
 
 		 290 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  29.73 
 
 		 297 aa  53.5  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  28.93 
 
 		 290 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  30 
 
 		 290 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  23.08 
 
 		 444 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  28.14 
 
 		 307 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  34.13 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  30 
 
 		 290 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  30 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  29.08 
 
 		 339 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  30.25 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  29.08 
 
 		 339 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  29.08 
 
 		 339 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  23.08 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1093  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 281 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.605646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  28.24 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  30.47 
 
 		 416 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  33.56 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  30.26 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  24.51 
 
 		 697 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>