118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1260 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1038    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  74.62 
 
 		 529 aa  759    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  65.35 
 
 		 532 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  52.6 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.38 
 
 		 517 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  51.15 
 
 		 517 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.07 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  49.31 
 
 		 506 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  48.63 
 
 		 531 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  44.61 
 
 		 529 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  48.63 
 
 		 531 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.85 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  45.43 
 
 		 545 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  45.48 
 
 		 520 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  31.42 
 
 		 496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  35.29 
 
 		 499 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  32.4 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.03 
 
 		 499 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  27.93 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  25.05 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  29.21 
 
 		 472 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  26.69 
 
 		 481 aa  146  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  28.35 
 
 		 475 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  23.28 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  23.3 
 
 		 463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  28.14 
 
 		 469 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  27.03 
 
 		 453 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.84 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  27.52 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  26.48 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  26.22 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.99 
 
 		 431 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  25.74 
 
 		 462 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  25.05 
 
 		 489 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  27.97 
 
 		 566 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  26.04 
 
 		 479 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  25.78 
 
 		 479 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.03 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  31.07 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.03 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  32.59 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.88 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  29.53 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  25.33 
 
 		 484 aa  94  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  26.28 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.99 
 
 		 457 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  22.7 
 
 		 413 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  21.81 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  30.09 
 
 		 441 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  22.61 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  31.69 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  29.46 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  31.69 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  29.46 
 
 		 444 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  37.5 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  33.94 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  34.86 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  29.46 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  30 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  21.03 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  32.12 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  29.92 
 
 		 398 aa  53.9  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  33.59 
 
 		 291 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  30 
 
 		 583 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  30.3 
 
 		 458 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  25.86 
 
 		 587 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  31.08 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  31.08 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  33.18 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  30.23 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  37.8 
 
 		 496 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_2271  predicted protein  32.12 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004103  ferrous iron transport protein B  31.34 
 
 		 758 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  30 
 
 		 412 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  35.43 
 
 		 447 aa  47.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  27.54 
 
 		 466 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  31.67 
 
 		 394 aa  47.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  33.98 
 
 		 192 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  33.7 
 
 		 410 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01364  hypothetical protein  30.6 
 
 		 758 aa  47.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  39.06 
 
 		 446 aa  47.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  31.25 
 
 		 548 aa  47  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 461 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  34.45 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  34.33 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  28.46 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  28.46 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  28.46 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4041  tRNA modification GTPase TrmE  34.12 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.934487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  28.46 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  32.28 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  34.11 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  29.17 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  29.6 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  30.89 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  30.38 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.89 
 
 		 546 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  27.94 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3192  hypothetical protein  29.46 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  29.85 
 
 		 758 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>