More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2246 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  100 
 
 		 496 aa  1020    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  39.2 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  38.29 
 
 		 438 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  38.65 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.01 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  39.1 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  38.43 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  37.33 
 
 		 439 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  37.72 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  36.67 
 
 		 441 aa  296  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  36.75 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  38.26 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  37.7 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  36.96 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.74 
 
 		 438 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  35.57 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  37 
 
 		 443 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  38.48 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  37.14 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  37.98 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  37.36 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  36.77 
 
 		 441 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  35.65 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  35.73 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  35.93 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  37.3 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  35.79 
 
 		 437 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  36.03 
 
 		 461 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  36.12 
 
 		 455 aa  282  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  35.87 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  36.47 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2356  GTP-binding protein EngA  35.75 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  35.49 
 
 		 456 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  35.68 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  36.32 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  36.5 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  35.49 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  36.3 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  36.55 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  35.48 
 
 		 493 aa  276  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  35.65 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  34.91 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  36.71 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  36.97 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  35.07 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  35.37 
 
 		 440 aa  273  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  35.18 
 
 		 456 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  36.3 
 
 		 452 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  36.3 
 
 		 452 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  34.09 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  36.47 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  34.17 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  34.42 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  36.08 
 
 		 436 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  34.7 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  35.86 
 
 		 436 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  37.13 
 
 		 443 aa  269  8e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  36.6 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  36.28 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  34.24 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  36.64 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  33.93 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  35.54 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  34.91 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  34.57 
 
 		 495 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  35.79 
 
 		 436 aa  267  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  36.64 
 
 		 465 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  35.97 
 
 		 464 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  34 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  37.78 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  33.93 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  35.48 
 
 		 454 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  36.12 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  34.82 
 
 		 457 aa  264  4e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  34.82 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  35.68 
 
 		 455 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0421  GTP-binding protein EngA  34.17 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0613118  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  35.99 
 
 		 435 aa  263  6e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  35.16 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  32.88 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0504  GTP-binding protein EngA  34.85 
 
 		 441 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  33.11 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17172  predicted protein  35.52 
 
 		 551 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.496601  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  33.94 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  34.59 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  34.75 
 
 		 443 aa  259  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  35.16 
 
 		 438 aa  259  8e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  34.46 
 
 		 441 aa  259  8e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.390352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>