More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2271 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_2271  predicted protein  100 
 
 
489 aa  990    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  39.03 
 
 
467 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  38.73 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  39.18 
 
 
458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  37.6 
 
 
470 aa  310  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
460 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  38.32 
 
 
459 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  37.83 
 
 
460 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  38.52 
 
 
459 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  38.4 
 
 
473 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  35.26 
 
 
473 aa  299  8e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  36.63 
 
 
447 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  38.19 
 
 
602 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  37.09 
 
 
460 aa  292  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  38.01 
 
 
454 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  34.9 
 
 
483 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  36.68 
 
 
455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  37.76 
 
 
479 aa  290  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  36.63 
 
 
474 aa  289  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  36.65 
 
 
474 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  35.81 
 
 
483 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  36.76 
 
 
446 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  35.62 
 
 
483 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
456 aa  287  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  37.45 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  38.07 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  37.45 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  35.15 
 
 
470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  37.63 
 
 
479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  37.25 
 
 
473 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  34.83 
 
 
477 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  38.68 
 
 
448 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  37.27 
 
 
489 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  36.33 
 
 
490 aa  279  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  35.24 
 
 
492 aa  277  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  36.96 
 
 
451 aa  276  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  34.33 
 
 
500 aa  276  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  35.93 
 
 
487 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  35.93 
 
 
487 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  35.53 
 
 
487 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  36.59 
 
 
461 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  34.09 
 
 
471 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  33.68 
 
 
440 aa  231  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  32.22 
 
 
488 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.15 
 
 
464 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1377  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 
488 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.694687  normal  0.70956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  32.78 
 
 
435 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3144  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 
488 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0749903 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2986  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 
488 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3001  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 
488 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  32.09 
 
 
488 aa  227  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1260  GTP-binding protein EngA  32.42 
 
 
491 aa  227  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00475437  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  32.22 
 
 
488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 
488 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 
488 aa  226  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 
488 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 
487 aa  226  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  31.62 
 
 
436 aa  226  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  31.78 
 
 
441 aa  225  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  32.33 
 
 
495 aa  224  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0421  GTP-binding protein EngA  31.62 
 
 
437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0613118  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  30.6 
 
 
442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1309  GTP-binding protein EngA  32.02 
 
 
490 aa  223  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00502538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  30.8 
 
 
440 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  32.85 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1548  GTP-binding protein EngA  31.63 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  31.29 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  32.65 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2356  GTP-binding protein EngA  31.62 
 
 
437 aa  221  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  32.87 
 
 
494 aa  219  7e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1294  GTP-binding protein EngA  32.42 
 
 
489 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237221  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  32.81 
 
 
490 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  31.9 
 
 
439 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  32.32 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  31.53 
 
 
500 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  32.03 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  33.13 
 
 
490 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  32.32 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 
436 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2013  GTP-binding protein EngA  31.56 
 
 
437 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 
436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  33.54 
 
 
443 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  32.1 
 
 
494 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.33 
 
 
438 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  30.52 
 
 
511 aa  217  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  33.13 
 
 
438 aa  217  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  30.74 
 
 
438 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  32.74 
 
 
490 aa  216  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  33.88 
 
 
467 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  31.02 
 
 
473 aa  216  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  30.75 
 
 
439 aa  216  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1287  GTP-binding protein EngA  33.88 
 
 
454 aa  216  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.720297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  32.74 
 
 
490 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>